R swave/ODFWeave和跟踪代码块

我开始使用R中的可复制研究工具，我对前景非常兴奋。斯维夫/克尼特/马克当，所有这些东西都很棒。我使用RStudio，他们在集成这些工具方面做得很好，我听说StatET也很好地将所有这些整合在一起

我不会用LaTeX写学术论文，所有和我一起工作的人都使用Word，所以我对使用ODFWeave制作文档的有效工作流程非常感兴趣

我通常的做法是：

在我的IDE中开发代码块（在我的例子中是RStudio）

返回并将其插入ODT文档中，并填写周围的文本

运行ODFweave

我的问题是，我在跟踪代码块并将其放入ODF文档时会感到困惑。在创建代码时保持ODF文档的同步很烦人，所以我宁愿等待并按名称插入代码块

最后，我有几个问题：

• 对于跟踪代码块或如何优化此工作流，人们有什么建议
• 有人能推荐一些工具或技巧来跟踪您编写的代码块吗

作为一个软件极客和一个数据迷，我自然会想象一个软件为我做这件事。就像我有一个代码块数据库一样，在编写ODF文档时，我可以单击一个块将其插入到我的ODF文件中

• 有人创造过这种东西吗

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当您检查标记为

odfweave

的物品数量时，您会注意到，与Swave和knit-off相比，它很少使用。我不完全理解为什么它没有启动，可能是因为表生成是一个非常讨厌的东西（至少我从尝试中记得）

由于许多客户坚持使用Word文档，我们目前使用两种替代方案：

• 创建html，例如使用RStudio/knitr/rmd，并使用Word阅读。这并不是一个很好的工作流，要获得合理的文档，您需要大量的人工后处理，但它或多或少可以工作
• 您还可以通过RDCOM使用路径。我不记得这里的最新技术是什么，因为我们完全放弃了使用它，因为许可条件对我们来说是不透明的
• 使用

  pandoc

  。这种方法生成的文档不需要在MS Word中进行手动后处理，但创建良好布局（交叉链接图像、图形编号）的功能范围有限；这可能是一个问题，我们在全面使用pandoc方面还不够好

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+10代表潘多克。我最近从R+latex切换到R+markdown，生成您可能想要的任何输出格式都非常容易；这种转换基本上是完美无瑕的，它不会将您束缚在任何特定输出格式的特性上——您只需编写文本，就像在电子邮件中一样。没有奇怪的格式标签，没有危险的软件联系。当然在格式和链接方面有一些限制，但是你可以在最终版本的报告中对最终输出进行润色。谢谢，我会查看pandoc。你们是否仍然在IDE中编辑swave/odfWeave/markdown的文本部分（在我的例子中是R Studio）？我有点喜欢在Writer中编写文本的WYSIWYG方面。是的，没有办法。有点像双向编辑器，但此时不太可能实现将Writer端口更改回IDE。LyX是最接近的，Yihui（knitr）非常喜欢它。不是odfweave，但无论如何，knitr有一个我广泛使用的外部化特性，它允许您将所有块放在一个单独的R文件中，并且只在knitr文档中按名称引用它们。