在R中使用DOI下载一篇文章

我有一篇文章的DOI，我想知道是否有R函数可以基于此DOI下载pdf文件，而用户不必手动下载pdf？

部分答案：

实际上，这是一个难题，与R。。。您能否演示如何以任何语言或设置从DOI转换为PDF

我能找到的最好的是：

您可以使用curl（可能因此

RCurl

或其他东西）来查询crossref内容协商系统。这可以为您的DOI返回引用。从那以后，获取PDF文件就很难了。。。如果你想这样做的话，至少你可以得到一个URL来获取PDF链接

这是jabRef用于将DOI转换为引文的方法

像Mendeley和Zotero这样的人已经编写了从网页到PDF的解析器。但我不认为有现成的方法可以做到这一点。

部分答案：

实际上，这是一个难题，与R。。。您能否演示如何以任何语言或设置从DOI转换为PDF

我能找到的最好的是：

您可以使用curl（可能因此

RCurl

或其他东西）来查询crossref内容协商系统。这可以为您的DOI返回引用。从那以后，获取PDF文件就很难了。。。如果你想这样做的话，至少你可以得到一个URL来获取PDF链接

这是jabRef用于将DOI转换为引文的方法

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像Mendeley和Zotero这样的人已经编写了从网页到PDF的解析器。但我不认为有现成的方法可以做到这一点。

您可以使用

httr

来查看DOI指向的位置，方法是构造一个指向

DOI.org

的URL并获取标题：

library(httr)
headers = HEAD("http://doi.org/10.7150/ijms.11309")
headers$url
# [1] "http://www.medsci.org/v12p0264.htm"

在本例中，PDF似乎与该页面位于同一位置，但扩展名为

.PDF

。但并非所有期刊都是如此

因此，对于本杂志，PDF位于：

sub(".htm$",".pdf",headers$url)
# [1] "http://www.medsci.org/v12p0264.pdf"

因此，我可以这样做：

download.file(sub(".htm$",".pdf",headers$url),"paper.pdf")

---

获取PDF

您可以使用

httr

通过构造

DOI.org

的URL并获取标题来查看DOI指向的位置：

library(httr)
headers = HEAD("http://doi.org/10.7150/ijms.11309")
headers$url
# [1] "http://www.medsci.org/v12p0264.htm"

在本例中，PDF似乎与该页面位于同一位置，但扩展名为

.PDF

。但并非所有期刊都是如此

因此，对于本杂志，PDF位于：

sub(".htm$",".pdf",headers$url)
# [1] "http://www.medsci.org/v12p0264.pdf"

因此，我可以这样做：

download.file(sub(".htm$",".pdf",headers$url),"paper.pdf")

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获取PDF

我猜，如果你没有机构访问权限，这些文章通常都在付费墙后面，你可能会很挣扎。@TheLate Mail，让我们假设我有机构访问权限，如果你告诉我们DOI，我们可能会找到一种适用于该杂志的方法。DOI通常不必有PDF版本，因此一般问题无法解决。@Spacedman，例如

DOI:10.7150/ijms.11309

我猜如果你没有机构访问权限，这些文章通常都会隐藏在付费墙后面，你可能会遇到困难。@thelatemail，让我们假设我已经制度化了access，如果你告诉我们DOI，我们也许能够找到一种适用于该日志的方法。DOI通常不必有PDF版本，因此一般问题无法解决。@Spacedman，例如

DOI:10.7150/ijms.11309

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