如何从elrm摘要输出中提取系数

我使用包

elrm

我将其与普通逻辑回归进行比较

我能够在普通的逻辑回归上进行引导，我感兴趣的统计数据是估计系数和p值

但是，我无法运行elrm引导，因为我无法从输出中提取所需的系数

根据我的数据，总结将打印出：

Results:
   estimate p-value p-value_se mc_size
M  0.15116 0.06594    0.00443   49000

95% Confidence Intervals for Parameters

     lower     upper
M 0.00156155 0.3647232

我想提取M估计值和p值，这样我可以在引导时提取这些统计数据。我尝试了一系列不同的组合来尝试提取这些值，但它们都不起作用

summary(model)$coefficient 
summary(model)$Results
summary(model)$estimate

所有这些都只是再次吐出了总结

是否有人知道是否可以从elrm摘要中提取

任何帮助都将不胜感激

库（elrm）
library(elrm)
data(drugDat)
drug.elrm <- elrm(formula=recovered/n~sex+treatment,interest=~sex+treatment,r=4, 
    iter=100000,burnIn=1000,dataset=drugDat)

> summary.elrm(drug.elrm)

Call:
[[1]]
elrm(formula = recovered/n ~ sex + treatment, interest = ~sex + 
    treatment, r = 4, iter = 1e+05, dataset = drugDat, burnIn = 1000)


Results:
          estimate p-value p-value_se mc_size
joint           NA 0.14886    0.00173   99000
sex        0.27092 0.69385    0.01204    2649
treatment  0.76739 0.07226    0.00314   13160

95% Confidence Intervals for Parameters

               lower    upper
sex       -0.6217756 1.212499
treatment -0.1216884 1.852346

# If you look at the summary function, it simply outputs formatted results to
# the screen. So instead, we can just work with the original drug.elrm object

names(drug.elrm)
# shows you everything in this object

# to see the p-values
drug.elrm$p.values.se
      joint         sex   treatment 
0.001734482 0.012039701 0.003143006 

# to get the p-value for joint
drug.elrm$p.values.se[[1]]

# now for the CI
drug.elrm$coeffs.ci
               lower    upper
sex       -0.6217756 1.212499
treatment -0.1216884 1.852346

> drug.elrm$coeffs.ci[[1]]
[1] -0.6217756 -0.1216884
> drug.elrm$coeffs.ci[[1]][1]
[1] -0.6217756
> 

数据（药物数据）
drug.elrm摘要.elrm（drug.elrm）
电话：
[[1]]
elrm（公式=康复/n~性别+治疗，兴趣=~性别+
治疗，r=4，iter=1e+05，数据集=drugDat，burnIn=1000）
结果：
估计p值p值使用mc大小
接头NA 0.14886 0.00173 99000
性别0.27092 0.69385 0.01204 2649
处理0.76739 0.07226 0.00314 13160
参数的95%置信区间
上下
性别-0.6217756 1.212499
处理-0.1216884 1.852346
#如果您查看summary函数，它只是将格式化的结果输出到
#屏幕。因此，我们可以只使用原始的drug.elrm对象
姓名（drug.elrm）
#显示此对象中的所有内容
#要查看p值
药品。elrm$p.values.se
联合性治疗
0.001734482 0.012039701 0.003143006 
#获取接头的p值的步骤
drug.elrm$p.values.se[[1]]
#现在是CI
药物。elrm$coeffs.ci
上下
性别-0.6217756 1.212499
处理-0.1216884 1.852346
>drug.elrm$coeffs.ci[[1]]
[1] -0.6217756 -0.1216884
>drug.elrm$coefs.ci[[1]][1]
[1] -0.6217756
> 

看起来p值和置信区间是作为模型对象本身的一部分存储的。

summary.elrm

函数只是为您提取并格式化一些信息。我在下面展示了我用来解决这个问题的步骤，但是摘要版本是分别为

object$p.values

和

object$coefs.ci

索引到模型对象本身

#Example from help page
data(utiDat) 
uti.elrm <- elrm(uti/n~age+current+dia+oc+pastyr+vi+vic+vicl+vis,
                 interest=~dia,r=4,iter=5000,burnIn=1000,dataset=utiDat)
#Look at summary
summary(uti.elrm)
#Let's examine the structure of the summary object to see what's in there, i.e.
#what can we extract?
str(summary(uti.elrm))
#Hmm, doesn't look like anything of interest. Let's look at the source code itself
summary.elrm
#Looks like the p.values are stored in the actual model object iself and the summary function
#just formats them for us. The relevant part of the summary code for the p-value is:
#-----
  #inferences = as.data.frame(cbind(round(as.numeric(object$coeffs),5), 
  #                                 round(as.numeric(object$p.values), 5), 
  #                                 round(as.numeric(object$p.values.se),5),
  #                                 object$mc.size)
  #                           )
  #results = data.frame(row.names = names(object$coeffs), inferences)
  #names(results) = c("estimate", "p-value", "p-value_se", "mc_size")
#So, it looks like we can grab the p.values directly from "object"
> uti.elrm$p.values
dia 
0.02225
#And the confidence intervals are also in the object, located here in the summary code:
#-----
  #cat(object$ci.level, "% Confidence Intervals for Parameters\n", 
  #    sep = "")
  #cat("\n")
  #print(object$coeffs.ci)
#So we can extract them thusly:
> uti.elrm$coeffs.ci
lower upper
dia 0.1256211   Inf

#帮助页面中的示例
数据（utiDat）
uti.elrm uti.elrm$p.values
迪亚
0.02225
#置信区间也在对象中，位于汇总代码中：
#-----
#cat（对象$ci.level，“%参数置信区间”\n“，
#sep=“”）
#猫（“\n”）
#打印（对象$coefs.ci）
#所以我们可以这样提取它们：
>uti.elrm$coeffs.ci
上下
直径0.1256211 Inf

+1-看起来我们在这里使用了非常类似的调试策略。