Rmarkdown和Renv的再现性问题

我最近注意到，相同的R标记文档在不同的条件下运行时生成了不同的图（例如，不同的项目）。作为一个玩具例子，考虑下面的文件：

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title: "Example"
output:
  html_document
---

```{r plot, warning=FALSE, echo=FALSE}
library("tidyverse")
tibble(mu = c(-9.4, -9.3, -9.2, -9, -8.9, -8.8, -8.7, -8.5, -8.4, -8.3, 0),
       N = c(1, 2, 1, 1, 1, 3, 1, 1, 1, 1, 3)) %>%
  ggplot() +
  geom_point(aes(x=mu, y=N)) + 
  geom_bar(aes(x=mu, y=N), stat="identity", fill="grey", colour="black", width=0.1) +
  theme(panel.background=element_blank(),
        axis.title=element_text(size=20),
        axis.text=element_text(size=15))
```

它应该会产生一个像下面这样的情节，有时我会成功并得到它：

然而，其他时候，我得到了另一个版本，这是胡说八道：

我注意到在加载tidyverse包之后，有些版本是不同的。例如，在第一个示例中，ggplot为3.2.1，而在后面的示例中，ggplot为3.3.0。这之后有一个不同的版本号，因为它在R项目中使用Renv单独维护

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好的，可能是不同的版本号吗？即使考虑到这些不同的版本（我很久以前就知道这个包），我也很难理解在任何ggplot版本的代码中如何生成第二个plot。如果不是版本号的话，是否有任何关于可能导致此问题的提示？

问题在于它有时会猜测一个方向，有时会猜测另一个方向。（您的坏图有水平条。）您可以使用

geom_bar

调用中的

orientation=“x”

强制垂直条

我认为这是一个错误，它似乎选择方向不确定（但见下面的评论）。我在我的系统上看到了同样的事情。我只使用了

ggplot2

3.3.0版；唯一的区别是我以前运行过的代码的历史记录

---

编辑添加：经过大量测试后，我无法再现不可再现性：-）

ggplot2

有一些复杂的方向猜测规则；对于数据的微小变化，它们是不稳定的，但对于固定数据，它们似乎是稳定的。我猜我无意中更改了数据集的字符，但没有意识到。

问题是它有时会猜测一个方向，有时会猜测另一个方向。（您的坏图有水平条。）您可以使用

geom_bar

调用中的

orientation=“x”

强制垂直条

我认为这是一个错误，它似乎选择方向不确定（但见下面的评论）。我在我的系统上看到了同样的事情。我只使用了

ggplot2

3.3.0版；唯一的区别是我以前运行过的代码的历史记录

编辑添加：经过大量测试后，我无法再现不可再现性：-）

ggplot2

有一些复杂的方向猜测规则；对于数据的微小变化，它们是不稳定的，但对于固定数据，它们似乎是稳定的。我猜我无意中更改了数据集的字符，但没有意识到这一点