rmarkdown.rmd文件中的Rstudio文件名完成
在Rstudio版本(1.0.143)中 我正在使用一个Rstudio包项目,并在其中使用Rmarkdown。所有代码文件都在./R文件夹中。所有数据文件都在./data文件夹中。默认的rmarkdown.rmd文件中的Rstudio文件名完成,r,rstudio,r-markdown,R,Rstudio,R Markdown,在Rstudio版本(1.0.143)中 我正在使用一个Rstudio包项目,并在其中使用Rmarkdown。所有代码文件都在./R文件夹中。所有数据文件都在./data文件夹中。默认的getwd()是父文件夹。/(包含./R和./Data) 我在RStudio中使用文件完成工具,我认为它非常有用。但是在.Rmd文件中,它并没有像预期的那样工作。例如,以下是两种情况: 在.R文件中,包含在./R文件夹中。我打开括号和 相对于getwd() 文件夹(即父文件夹)。因此,./R中的文件“hello
getwd()
是父文件夹。/(包含./R和./Data)
我在RStudio中使用文件完成工具,我认为它非常有用。但是在.Rmd文件中,它并没有像预期的那样工作。例如,以下是两种情况:
- 在.R文件中,包含在./R文件夹中。我打开括号和
相对于
文件夹(即父文件夹)。因此,./R中的文件“hello.R”将完成如下操作 “/R/hello.R”getwd()
- 在.Rmd文件中,也包含在./R文件夹中。我开始一个R块。我
打开括号,完成时不会给我“/R”
文件夹,即使
给出了父级“/”,但 在./R中完成文件“hello.R”会得到“hello.R”getwd()
> sessionInfo()
R version 3.4.1 (2017-06-30) Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit) Running under: Windows 7 x64 (build 7601) Service Pack 1
Matrix products: default
locale: [1] LC_COLLATE=English_United States.1252 LC_CTYPE=English_United States.1252 LC_MONETARY=English_United States.1252 [4] LC_NUMERIC=C LC_TIME=English_United States.1252
attached base packages: [1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
loaded via a namespace (and not attached): [1] Rcpp_0.12.12 compiler_3.4.1 RColorBrewer_1.1-2 plyr_1.8.4 base64enc_0.1-3 tools_3.4.1 rpart_4.1-11 [8] digest_0.6.12 evaluate_0.10.1 tibble_1.3.4 gtable_0.2.0 htmlTable_1.9 checkmate_1.8.3 lattice_0.20-35 [15] rlang_0.1.2 Matrix_1.2-11 gridExtra_2.2.1 stringr_1.2.0 cluster_2.0.6 knitr_1.17 htmlwidgets_0.9 [22] grid_3.4.1 nnet_7.3-12 data.table_1.10.4 survival_2.41-3 foreign_0.8-69 pacman_0.4.6 latticeExtra_0.6-28 [29] Formula_1.2-2 ggplot2_2.2.1 magrittr_1.5 Hmisc_4.0-3 scales_0.5.0 backports_1.1.0 htmltools_0.3.6 [36] splines_3.4.1 colorspace_1.3-2 stringi_1.1.5 acepack_1.4.1 lazyeval_0.2.0 munsell_0.4.3
RStudio文件名完成基于当前工作目录,即您自己识别的
getwd()
编织Rmd文件时,包含Rmd文件的目录用作工作目录。因此,当在/R
中找到Rmd文件时,它将成为您的工作目录
最简单的解决方案是在开发Rmd文件时将工作目录更改为/R
有一些选项供您调查。RStudio使用rmarkdown包中的渲染
。例如,参见?rmarkdown::render
;查看knit\u root\u dir
。
您的knitr文档也可以通过以下方式获得:
knit::opts_knit$set(root.dir='../')
编辑:RStudio(v.1.0.136)似乎足够聪明,能够识别knitr文档将基于其目录编制,因此使用该目录的自动完成,而不是
getwd()
RStudio文件名完成基于当前工作目录,即getwd()
正如您自己所确认的
编织Rmd文件时,包含Rmd文件的目录用作工作目录。因此,当在/R
中找到Rmd文件时,它将成为您的工作目录
最简单的解决方案是在开发Rmd文件时将工作目录更改为/R
有一些选项供您调查。RStudio使用rmarkdown包中的渲染
。例如,参见?rmarkdown::render
;查看knit\u root\u dir
。
您的knitr文档也可以通过以下方式获得:
knit::opts_knit$set(root.dir='../')
编辑:RStudio(v.1.0.136)似乎足够聪明,能够识别knitr文档将基于其目录进行编织,因此使用该目录的自动完成,而不是
getwd()
,这是我的想法,但在我的情况下并不正确。在Rstudio中的包项目中,包含文件的主目录是“/R”,而getwd()
文件夹是“/”。如果.Rmd在“/R”中,当我运行块时,getwd()
文件夹是“/”。另外,当我编织它时,getwd()
文件夹也是“/”!只是完成的过程被搞砸了。对于每个自动完成文件名,我必须添加“../R”,以便该文件编织或运行所有块。我认为你所说的可能以前是真的,但现在不再是我的Rstudio版本(1.0.143)——这很好。在包项目中,getwd()
仍然可以是任何东西。RStudio默认为包根目录。根据我的经验,对于R文件,RStudio将文件完成基于getwd()。让我尝试将Rmd文件移动到其中一个文件夹。也许那样我就不会有问题了。有人找到办法解决这个问题了吗?我有一个Rmd文档位于./code中,但是通过开头块中的一行将其wd设置为根目录(.):knitr::opts_knit$set(root.dir=“..”),但是,当在Rmd文档中写入文件时,如果用tabout查找文件,它仍然坚持在./code目录中启动,即使控制台的工作目录设置为根目录。在RStudio IDE设置中以某种方式设置它会很好。对不起,我之前的评论太仓促了。“./”是指父目录。这是我的想法,但在我的情况下不正确。在Rstudio中的包项目中,包含文件的主目录是“/R”,而getwd()
文件夹是“/”。如果.Rmd在“/R”中,当我运行块时,getwd()
文件夹是“/”。另外,当我编织它时,getwd()
文件夹也是“/”!只是完成的过程被搞砸了。对于每个自动完成文件名,我必须添加“../R”,以便该文件编织或运行所有块。我认为你所说的可能以前是真的,但现在不再是我的Rstudio版本(1.0.143)——这很好。在包项目中,getwd()
仍然可以是任何东西。RStudio默认为包根目录。根据我的经验,对于R文件,RStudio将文件完成基于getwd()。让我尝试将Rmd文件移动到其中一个文件夹。也许那样我就不会有问题了。有人找到办法解决这个问题了吗?我有一个Rmd文档位于./code中,但是通过开头块中的一行将其wd设置为根目录(.):knitr::opts_knit$set(root.dir=“..”),但是,当在Rmd文档中写入文件时,如果用tabout查找文件,它仍然坚持在./code目录中启动,即使控制台的工作目录设置为根目录。那就是尼克