在Centos6和x27上安装Rmpi；can'；t find-lmpi'；_R_Centos_Mpi

在Centos6和x27上安装Rmpi；can'；t find-lmpi'；

r centos mpi

在Centos6和x27上安装Rmpi；can'；t find-lmpi'；,r,centos,mpi,R,Centos,Mpi,嘿，我在这里看到了以下两个问题：但他们没有提供任何具体的问题答案以下是一些相关信息： R> system('echo "$LD_LIBRARY_PATH"') /usr/lib64/R/lib:/usr/local/lib64:/usr/lib/jvm/jre/lib/amd64/server:/usr/lib/jvm/jre/lib/amd64:/usr/lib/jvm/java/lib/amd64:/usr/java/packages/lib/amd64:/lib:/usr/l

嘿，我在这里看到了以下两个问题：

但他们没有提供任何具体的问题答案

以下是一些相关信息：

R> system('echo "$LD_LIBRARY_PATH"')
/usr/lib64/R/lib:/usr/local/lib64:/usr/lib/jvm/jre/lib/amd64/server:/usr/lib/jvm/jre/lib/amd64:/usr/lib/jvm/java/lib/amd64:/usr/java/packages/lib/amd64:/lib:/usr/lib:/usr/lib64/openmpi/lib

R> install.packages("Rmpi", configure.args="--with-Rmpi-include=/usr/include/openmpi-x86_64 --with-Rmpi-libpath=/usr/lib64/openmpi --with-Rmpi-type=OPENMPI")

这是错误消息的最后一部分：

gcc -m64 -std=gnu99 -shared -L/usr/local/lib64 -o Rmpi.so RegQuery.o Rmpi.o conversion.o internal.o -L/usr/lib64/openmpi -lmpi -L/usr/lib64/R/lib -lR
/usr/bin/ld: cannot find -lmpi
collect2: ld returned 1 exit status
make: *** [Rmpi.so] Error 1

任何帮助都会很好。谢谢。

安装

openmpi-devel

后，我在

/usr/lib64/openmpi/lib/

中看到了

libmpi.so

$ sudo yum install openmpi-devel
$ sudo updatedb
$ locate libmpi.so
/usr/lib64/openmpi/lib/libmpi.so
/usr/lib64/openmpi/lib/libmpi.so.1
/usr/lib64/openmpi/lib/libmpi.so.1.0.2

以下方面应起作用：

install.packages(
  "Rmpi", 
  configure.args = paste( 
    "--with-Rmpi-include=/usr/include/openmpi-x86_64",
    "--with-Rmpi-libpath=/usr/lib64/openmpi/lib",
    "--with-Rmpi-type=OPENMPI"
  )
)

如果可能需要，请告诉系统在此目录中查找共享库，以及：

# echo "/usr/lib64/openmpi/lib" > /etc/ld.so.conf.d/openmpi.conf
# ldconfig

你确定

libmpi.so

在

/usr/lib64/openmpi

中吗？应该是

/usr/lib64/openmpi/

库吗？谢谢你的帮助。这是一个办公室设置。出于多种原因，我们最终决定转用Ubuntu。不管怎样，如果你能证实这是有效的，我会接受这个答案。谢谢。我在CentOS虚拟机上进行了检查：在更改为

ld.so.conf

后，该软件包已成功安装，但我尚未实际使用它。