R中的readRDS（文件）

每当我尝试在R中安装软件包时，都会出现以下错误：

Error in readRDS(file) : unknown input format

这是在我的系统崩溃后开始的。我在Windows7下运行32位R2.13.0。我试图删除并重新安装R，但仍然出现错误。是否有任何方法可以在不删除所有内容（即我已安装的所有软件包）并重新开始的情况下修复此问题

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谢谢

这些是我遇到的建议：

删除运行R的目录中的

.Rhistory

和

.RData

文件

运行

update.packages（）

尝试检测库目录中的“坏文件”。您可以在R中执行此操作

# List the library paths
# The issue is likely to be in the first directory
paths = .libPaths()

## Try and detect bad files
list.files(paths, 
       pattern = "^00LOCK*|*\\.rds$|*\\.RDS$",
       full.names = TRUE)

## List files of size 0
l = list.files(paths, full.names = TRUE)
l[sapply(l, file.size) == 0]

删除突出显示的任何文件/目录。如果确实需要，可以使用

file.remove（）

删除存储下载包的目录

只有解决方案3对我有效

参考：

• 选项3是过去几年不同人士提供的答案的组合，包括徐春晓、拉里·亨西克和弗兰克·哈雷尔

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运行

find/usr/local/lib/R/site library//usr/lib/R/library//.local/lib/-iname'*rds'-a-size 0

，然后删除找到的文件。

徐春晓和Rando Hinn上面的解决方案对我有效，只是做了一点小小的调整

首先，将目录更改为personal R package目录，然后运行：find-iname'*rds'-a-size 0

删除包含上述列表中任何0长度文件的目录。然后重新打开R（或RStudio）并重新安装删除的软件包

您现在应该能够再次列出包

上面徐春晓的原始建议列出了所有的R包目录。但这些目录的确切位置因安装而异，并且必须为您的安装编辑它们的地址

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Larry Hunsicker

尝试一些简单的方法：如果是.rda文件，请使用

load

而不是

readRDS

。然后，您可以将加载的文件保存为.rds，然后再次尝试

readRDS

您可能对R包有一些问题。 查看问题是在您安装了一些打包软件后出现的，还是您复制了这些软件包

您可以做的是从库中复制所有包并将其保存在某个位置，然后在库中复制一些包并重新启动R测试它，看看它是如何工作的您必须逐个尝试所有包。

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我有同样的问题，这是由于包装问题

我在几个论坛上查看了这个问题，然后我尝试了这个，它对我起了作用：

1） 首先删除ggplot2包

remove.packages("ggplot2")

2） 然后再次安装该软件包

install.packages("ggplot2")

3） 重新启动rstudio并再次安装您的软件包，希望这对您有所帮助

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似乎问题在于所需的包（在我的例子中是ggplot2）已损坏，并妨碍了任何新的依赖包的安装00LOCK目录。

以下是解决此错误的方法：

• 打开您的Rstudio，转到“软件包”下的“安装”选项卡
• 请注意您的安装到库路径。（将保存软件包的位置）
• 转到安装库路径。然后硬删除最近的软件包
• 在Rstudio中刷新您的软件包详细信息

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我在打开.RDS文件时也遇到了一些问题，可能是“从连接读取错误”或“未知输入格式”。我尝试了几个R版本，版本3.4.2。以下方面发挥了作用： （我意外地卸载了rstudio并再次安装了它，还安装了较旧的R版本3.4.2，我不知道这是否会改变什么）

设置新的工作目录

我直接打开RDS文件而不是下载它（所以只保存到临时文件），然后我就可以在R中打开它了

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我将它从临时文件移到了新的工作目录，并使用了

Data\u-assession\u-Account与这里的前几个答案不同，我的问题不是通过安装RStudio或清理本地文件来解决的，而是通过重新写入
RDS
文件来解决的

我可以确认这一点，因为该文件存储在云中，从各种windows和mac笔记本电脑读取它都失败了，但来自同一S3存储桶的类似
RDS
文件工作正常

当我重新编写
RDS
文件时，问题消失了
 同样的故事。我不得不换一个目录我已经尝试了以上所有的解决方案，但似乎都不起作用。我找不到.rhistore和Rdata文件。@amc同意。我已经创建了一个简单的R解决方案来尝试检测坏文件/目录。对我来说，这与一个有问题的库有关，该库中有一个由较新的R生成的rds文件。在找到一个库之前，我手动尝试删除了几十个库。我希望我先找到这个解决方案！我在解决方案3中运行代码，但它只返回目录中的路径，即。您能解释一下如何使用
file.remove（）
自动删除大小为0的文件吗？我已经安装了R3.4，注意到这个错误经常发生。令人惊讶的是，安装R3.3而不是3.4解决了这个问题。（这可能是什么原因？@nikpod如果您在3.3中保存了该文件，则可能无法在3.4中读取该文件。请使用格式化工具正确编辑和格式化您的问题/答案。句子中的代码要格式化为
code
非常重要的单词要加粗，不太重要的单词要斜体，必要时还可以使用列表。这样做很有效（无需删除整个软件包目录）。我还必须删除一个包