以R显示差异分析树（使用graphviz）

我正在R中进行差异分析，在用graphviz显示树时遇到问题。我做了Studer等人2011年在《Guillet al:知识发现和管理进展》中所描述的一切。我使用disstree命令构建名为tree.lcp的树，然后尝试使用graphviz显示它：

seqtree2dot(tree.lcp, filename="hh.lcp", seqdata=seqhh)

shell("dot -Tsvg -O hh.lcp.dot") 

第一个命令没有问题，但第二个命令会显示以下错误消息：

找不到命令点。 错误消息： 1:命令“C:\Windows\system32\cmd.exe/C dot-Tsvg-O hh.lcp.dot”给出了状态1 2：在shelldot-Tsvg-O hh.lcp.dot中： “dot-Tsvg-O hh.lcp.dot”进程失败-错误代码1

我想这与path命令see有关，但我将GraphViz安装到了C:\Program Files x86\GraphViz 2.36，我知道这是默认的

知道问题出在哪里吗？如果问题仍然是path命令，那么如何在shell命令中包含路径

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谢谢！Katharina

最新的TraMineR版本有一个新功能，可以直接运行所有内容。该函数称为seqtreedisplay

seqtreedisplaytree.lcp，类型=d

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尝试运行：TraMineR.checkupdates以了解您是否有最新的稳定版本。

最新的TraMineR版本有一个新功能，可以直接运行所有内容。该函数称为seqtreedisplay

seqtreedisplaytree.lcp，类型=d

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尝试运行：TraMineR.checkupdates以了解是否有最新的稳定版本。

您可以按如下方式指定路径

shell(paste('"C:/Program Files (x86)/Graphviz2.36/dot"','-Tsvg -O hh.lcp.dot'))

但是，如果要根据序列之间的差异绘制树，则最好使用较新的简化seqtreedisplay函数，该函数直接从seqtree对象（即seqtree函数的结果）生成绘图。通常，seqtreedisplay应该自己找到Graphviz

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有关更多详细信息，请键入helpseqtreedisplay查看帮助页面。

您可以按如下方式指定路径

shell(paste('"C:/Program Files (x86)/Graphviz2.36/dot"','-Tsvg -O hh.lcp.dot'))

但是，如果要根据序列之间的差异绘制树，则最好使用较新的简化seqtreedisplay函数，该函数直接从seqtree对象（即seqtree函数的结果）生成绘图。通常，seqtreedisplay应该自己找到Graphviz

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有关更多详细信息，请键入helpseqtreedisplay查看帮助页面。

@gilbert@Mattias Studer:seqtreedisplay，或者更准确地说，disstreedisplay命令正是我所需要的。Graphviz是自动找到的，我现在有树了。谢谢Katharina@Katharina请投票支持并接受吉尔伯特的答案，吉尔伯特的答案似乎更准确。如果你这样做，未来遇到类似问题的读者现在将知道如何解决它。@gilbert@Mattias Studer:seqtreedisplay，或者更准确地说disstreedisplay命令正是我所需要的。Graphviz是自动找到的，我现在有树了。谢谢Katharina@Katharina请投票支持并接受吉尔伯特的答案，吉尔伯特的答案似乎更准确。如果你这样做，未来的读者会遇到类似的问题，现在将如何解决它。