Can'；t了解如何在networkite:：use_condaenv（path）之后使用conda环境

我使用终端创建了一个conda环境：

conda create --name pathfinder_example_proj_env python=3.6 feather-format=0.4.0 statsmodels=0.9.0

我还创建了一个简单的python脚本

import feather
import pandas as pd
import statsmodels.api as sm

print("Done")

在R笔记本中，我现在希望在我先前创建的conda环境中运行该脚本

我试过：

reticulate::use_condaenv("pathfinder_example_proj_env", required = TRUE)
reticulate::source_python("../python/python_model.py")

但我得到了以下错误：

Error in py_run_file_impl(file, local, convert) : ImportError: No module named feather

当我检查python Networkite使用的版本时，我得到：

reticulate::py_config()

python:         /usr/bin/python
libpython:      /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/config/libpython2.7.dylib
pythonhome:     /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7:/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7
version:        2.7.10 (default, Oct  6 2017, 22:29:07)  [GCC 4.2.1 Compatible Apple LLVM 9.0.0 (clang-900.0.31)]
numpy:          /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/numpy
numpy_version:  1.8.0

python versions found: 
 /usr/bin/python
 /Users/bradcannell/anaconda/bin/python
 /Users/bradcannell/.virtualenvs/bradcannell-_MDC9FPE/bin/python

我使用py_discover_config（）检查了可用版本

如您所见，虚拟环境已列出。我只是不知道如何使用它

我已经阅读了网状网站上的所有文章：

我还在Github上发现了几个线程：

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我在这里找到了解决方案：

安装开发版本的Netracite（devtools:：install_github（“rstudio/netracite”）后，Netracte将按预期使用conda环境

保留此帖子，以防其他人遇到此问题。

这件事奏效了：

通过将网状PYTHON环境变量的值设置为PYTHON二进制文件。请注意，如果设置此环境变量，则将始终使用指定版本的PYTHON（即，这是规定性的，而不是建议性的）。要设置网状PYTHON的值，请插入Sys.setenv（网状PYTHON=PATH）进入项目的.Rprofile，其中PATH是您首选的Python二进制文件。

这对我很有用

library(reticulate)

myenvs=conda_list()

envname=myenvs$name[2]
use_condaenv(envname, required = TRUE)
# or
use_condaenv("r-miniconda", required = TRUE)

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有时需要重新启动r会话。

对我很有用！我使用的是python路径，而不是env名称。谢谢！

library(reticulate)

myenvs=conda_list()

envname=myenvs$name[2]
use_condaenv(envname, required = TRUE)
# or
use_condaenv("r-miniconda", required = TRUE)