R 将图形写入文件不保留顶点名称

当我试图将图形写入文件时，输出文件不会保留顶点名称。 代码如下：

edgelist = read.csv("test.csv",header=FALSE,sep=",")
g = graph.edgelist(as.matrix(edgelist),directed=FALSE)
V(graph)$name <- V(graph)
graph  <- delete.vertices(graph, which(degree(graph) < 1))
write.graph(g, "temp.txt", "edgelist")

temp.csv：

0 4
0 5
1 4
1 6
2 5
2 6
3 7

“edgelist”格式始终为数字格式，因此不使用顶点名称。如果要保留名称，请使用其他格式，例如

ncol

：

g <- graph.formula(a-b-c)
write.graph(g, format="ncol", file="test.ncol")

g2 <- read.graph("test.ncol", format="ncol")
str(g2)
# IGRAPH UN-- 3 2 -- 
# + attr: name (v/c)
# + edges (vertex names):
# [1] a--b b--c

---

相反。

as.character选项对我不起作用。我找到的解决办法是：

V(graph)$id = V(graph)$name

---

Gabor Csardi使用

get.edgelist

和

write

（我使用ncolumns=2）手动导出的另一个答案确实给了我奇怪的结果：许多边以某种方式被复制和扭曲。 我特别需要在R-igraph和Python-networkX之间进行转换 我使用的常用格式是“graphml” 我使用R导出：

write_图形（igraphNetwork，paste0（“edgelist/”，filename“.graphml”），format=“graphml”）

并使用Python导入：

G=nx.read\u图形（路径）
G=nx.relabel\u节点（G，nx.get\u节点属性（G，'name'））

---

当我重新导入到R时，我确保所有标签节点都匹配，并通过简单的度中心性比较进行检查，确保一切正常。我使用网状包在R和Python之间通信。

edgelist格式不使用顶点名称。使用另一种格式，或手工编写，即使用

get.edgelist

查询命名的文件，然后使用

write

。谢谢您的代码。我在上面示例中提供的数据上尝试了它，得到了：At rinterface.c:1225:属性不是字符，无效值我使用的是“graphml”格式，看起来它考虑了节点的名称。参见我的编辑，

V（g）$name

不是字符类型，这有时会导致问题。

V(graph)$name <- V(graph)

V(graph)$name <- as.character(V(graph))

V(graph)$id = V(graph)$name