R CMD检查不识别S3泛型方法

我正在编写一个包，如果我在Rstudio中运行代码，它就会运行，但当我将它交给R CMD check运行时，它就无法识别S3方法。 我有一个通用方法：

count_kmers <- function(obj, klen = 6, parallel = TRUE, 
                    nproc = ifelse(parallel, comm.size(), 1), 
                    distributed = FALSE) {
                          UseMethod("count_kmers", obj)
                }

AAStringSet是Biostrings包中的一个对象。但这并不重要，即使我将字符串传递给count_kmers，我也会收到相同的错误，但会说：

no applicable method for 'count_kmers' applied to an object of class "character".

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您确定正在运行R CMD的脚本中加载包吗？在R Studio中加载包而不是脚本是一个很容易犯的错误，这会导致确切的错误消息。您是否在GitHub等地方有可用的包代码？如果不查看包结构和代码，就很难解决R CMD检查问题。泛型和方法是否在同一个文件中？这两种方法是否都正确导出到

命名空间中导出（计数字符）；出口（计数/公里数.AAStringSet）；S3方法（计数公里数，字符）；S3method（count_kmers，AAStringSet）`@jpd527您是指vignettes文件吗？是的，我在vignettes的代码开头有一个library（）。
seqs <- AAStringSet(c("seq1"="MLVVD",
                  "seq2"="PVVRA",
                  "seq3"="LVVR"))
## Count the kmers and generate a dataframe of the frequencies
freqs <- count_kmers(seqs, klen = 3, parallel = FALSE)
head(freqs)

Error in UseMethod("count_kmers", obj) : 
no applicable method for 'count_kmers' applied to an object of class "c('AAStringSet', 'XStringSet', 'XRawList', 'XVectorList', 'List', 'Vector', 'list_OR_List', 'Annotated')"

no applicable method for 'count_kmers' applied to an object of class "character".