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让Rscript读取或从stdin获取输入

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让Rscript读取或从stdin获取输入,r,bash,stdin,R,Bash,Stdin,我了解了在给定文件名作为参数时，如何让Rscript执行我想要的操作，例如，如果我的Rscript被称为script，并且包含： #!/usr/bin/Rscript path <- commandArgs()[1] writeLines(readLines(path)) 并成功地将filename.Rmd的内容回显给我。如果我不想传递像filename.Rmd这样的文件名，而是想从stdin传递文本，我会尝试修改脚本以从stdin读取： #!/usr/bin/Rscript wri

我了解了在给定文件名作为参数时，如何让Rscript执行我想要的操作，例如，如果我的Rscript被称为
script
，并且包含：

#!/usr/bin/Rscript 
path <- commandArgs()[1]
writeLines(readLines(path))
并成功地将
filename.Rmd
的内容回显给我。如果我不想传递像
filename.Rmd这样的文件名，而是想从
stdin
传递文本，我会尝试修改脚本以从stdin读取：


#!/usr/bin/Rscript 
writeLines(file("stdin"))


但是我不知道如何为这个案例构造命令行调用。我尝试在内容中添加管道：


cat filename.Rmd | Rscript script --args dev='svg'


并尝试重定向：


Rscript script --args dev='svg' < filename.Rmd



（我还尝试了
打开（文件（“stdin”）
）。我不确定是Rscript构造不正确，还是命令行参数构造不正确，或者两者都不正确
 您需要从
file（“stdin”）
创建的连接中读取文本，以便将任何有用的内容传递给
writeLines（）的
text
参数。这应该行得通


#!/usr/bin/Rscript 
writeLines(readLines(file("stdin")))



可能重复，但您的错误可能是使用
writeLines
读取vs
readLines
谢谢；使用
readLines（file（“stdin”）
代替
open（file（“stdin”））
解决了我的问题。

Error in writeLines(file("stdin")) : invalid 'text' argument



#!/usr/bin/Rscript 
writeLines(readLines(file("stdin")))