R 如何使用相关性或聚类分析组织数据以创建热图（x必须是数字问题）

我需要一些用聚类分析和相关性生成热图的帮助（我是R新手）。我的数据在Excel中如下所示：

               Gene1   Gene2   Gene3   Gene4   Gene5  ...  Gene296

   Bacteria1     0       0       0      0.7     0.2   ...     0

   Bacteria2    0.44     0       0       0       0    ...    0.9 

   Bacteria2     0      0.32     0      0.4      0    ...     0

     ...        ...     ...     ...     ...     ...   ...    ...

   Bacteria117   0      0.2     0.3      0      0.7   ...     0

值0.32表示从0到100的32分。得分较高（例如0.9分）或较低（例如0分或0.2分）。我检查了NAs，但没有。我想做聚类分析，根据我的实验数据（分数），找出哪些细菌形成了聚类。该文件是CSV。我使用了以下代码：

> aa <- read.csv(file.choose())
> str(aa)

#I obtain this structure

'data.frame':   117 obs. of  296 variables:
 $ X                        : Factor w/ 117 levels "Ac_neuii_BVI",..: 45 64 67 104 1 2 3 4 5 6 ...
 $ AAC6_Iad                 : num  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
 $ aad6                     : num  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
 $ abeS                     : num  0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...

> is.numeric(aa)
[1] FALSE

aa str（aa） #我得到这个结构 “data.frame”：117 obs。在296个变量中： $X：系数w/117“新英属维尔京群岛”等级，45 64 67 104 1 2 3 4 5 6。。。 $AAC6_Iad:num 0 0 0 0 0。。。 $aad6:num 0 0 0 0 0 0。。。 $abeS:num 0 0 0 0 0 0。。。 >is.数字（aa） [1] 假的 当我尝试使用相关性或聚类时，会出现以下错误：

> az <- cor(aa)
Error in cor(aa) : 'x' must be numeric

---

>az
aa$X
不是数字（它包含因子）。您可以使用以下方法对其进行变换：

aa$X = as.numeric(aa$X)

然后
az您可以将细菌名称作为行导入。名称：

aa <- read.csv(file.choose(), row.names = 1)

aa您所做的编辑与@Cole的另一个答案类似。
aa <- read.csv(file.choose(), row.names = 1)