Regex 在Perl中按相反顺序匹配字符串

Regex 在Perl中按相反顺序匹配字符串,regex,perl,match,Regex,Perl,Match,我有一个文件,第一列中有成对的字符串,它们之间用空格隔开,另外两列中有值。 我想创建一个新文件,其中字符串对在同一行中匹配,而不管它们的顺序如何。 例如,打印包含对“GAT_1 GAT_2”的行,以及旁边包含“GAT_2 GAT_1”的行。 将每个字符串分配给给定对的变量后,如何在不重复的情况下比较不同行的字符串 # discard headers foreach $line (@file) { @columns = split (/\t/, $line); @strings = sp

我有一个文件,第一列中有成对的字符串,它们之间用空格隔开,另外两列中有值。 我想创建一个新文件,其中字符串对在同一行中匹配,而不管它们的顺序如何。 例如,打印包含对“GAT_1 GAT_2”的行,以及旁边包含“GAT_2 GAT_1”的行。 将每个字符串分配给给定对的变量后,如何在不重复的情况下比较不同行的字符串

# discard headers

foreach $line (@file) {
  @columns = split (/\t/, $line);
  @strings = split (/\s/, $columns[0]);
    # pseudocode:
foreach line that has pair "$strings[0] $strings[1]" {
    print $line,"\t", and $line where pair is "$strings[1] $strings[0]"

Input:
   pair         val1    val2
GAT_1 GAT_2     0.2     4.5
GAT_1 GAT_3     0.1     0.2
GAT_4 GAT_5     0.9     7.5
GAT_5 GAT_4     0.5     8.3
BLAC BABA       8.3     1.3
BABA BLAC       8.9     1.1
GAT_2 GAT_1     1.2     2.1
GAT_3 GAT_1     3.4     4.3


Ouput:
   pair        val1     val2       pair        val1   val2
GAT_1 GAT_2     0.2     4.5    GAT_2 GAT_1     1.2     2.1
GAT_1 GAT_3     0.1     0.2    GAT_3 GAT_1     3.4     4.3
GAT_4 GAT_5     0.9     7.5    GAT_5 GAT_4     0.5     8.3
BLAC BABA       8.3     1.3    BABA BLAC       8.9     1.1

这里有一种解决这个问题的方法,它适用于任意数量的值列。基本方法是我在我的文章中建议的,即规范化键,然后将找到的任何值推送到数组中

use strict;
use warnings;

my %unique;

while (<DATA>) {
    chomp;
    next unless /^\S/;
    my @fields = split;

    my $key = join(' ', sort(splice(@fields, 0, 2)));
    push(@{$unique{$key}}, @fields);
}

for my $key (keys(%unique)) {
    print join("\t", $key, @{$unique{$key}});
    print "\n";
}

__DATA__
   pair         val1    val2
GAT_1 GAT_2     0.2     4.5
GAT_1 GAT_3     0.1     0.2
GAT_4 GAT_5     0.9     7.5
GAT_5 GAT_4     0.5     8.3
BLAC BABA       8.3     1.3
BABA BLAC       8.9     1.1
GAT_2 GAT_1     1.2     2.1
GAT_3 GAT_1     3.4     4.3
小的变化将给你你想要的: (未经测试):

my@keys=拼接(@fields,0,2);
我的$key=join(“”,@key);
my$skey=join(“”,sort@keys);
push(@{$unique{$skey}{$key}},@fields);


对于我的$skey(密钥(%unique)){
对于我的$key(key(%unique{$skey})){
打印连接(“\t”,$key,@{$unique{$skey}{$key}});
打印“\t”;
}
打印“\n”;
}

您只关心具有匹配(反向)对的行吗?此外,如何在拆分后强制执行严格数量的值?当然,这是干什么用的?看起来你自己并没有尽力去解决这个问题。伪代码是一个开始,但实际工作如何?@sln是的,我只关心那些行,但它们都应该有一个匹配的反向对。我试图避免为每个匹配生成具有以下输出的文件:pair val1 val2 pair val1 val2 GAT_1 GAT_2 0.2 4.5 GAT_2 GAT_1 1.2 2 2.1 GAT_2 GAT_1 1 1.2 2 2.1 GAT_1 GAT_2 0.2 4.5但我不知道如何在拆分后强制执行严格数量的值。这是为了消除文件中的冗余,因为对被视为不同的实体,但它们实际上是相同的。@马特·雅各布我真的想不出一个算法来解决这个问题,问题应该是“这有可能吗?”这是编程——任何事情都有可能专门研究散列。你的输入文件有多大?我现在明白你说的“规范化”是什么意思了。这是我自己无法理解的“拼接”。谢谢为什么需要“next EXCELLED/^\S/;”?
next EXCELLED…
行跳过具有前导空格的行,这会忽略标题行。如果$.==1以明确跳过第一行。感谢您的解释。
GAT_4 GAT_5     0.9     7.5     0.5     8.3
GAT_1 GAT_2     0.2     4.5     1.2     2.1
BABA BLAC       8.3     1.3     8.9     1.1
GAT_1 GAT_3     0.1     0.2     3.4     4.3