Sorting 皮卡德·索萨姆，加速？
我想知道如何加速皮卡德的SortSam？运行它需要很长时间，我知道GATK可以是多线程的，但我还没有在Picard上找到示例Sorting 皮卡德·索萨姆，加速？,sorting,bioinformatics,picard,Sorting,Bioinformatics,Picard,我想知道如何加速皮卡德的SortSam？运行它需要很长时间，我知道GATK可以是多线程的，但我还没有在Picard上找到示例 我想知道其他人是如何解决这个问题的 不幸的是，由于问题的性质，无法加快对随机BAM文件的排序速度。这就是为什么工具不提供多线程的原因。你可以考虑使用SAMORTORE排序而不是PICARD。您可以将多个CPU线程与samtools sort一起使用。
我想知道其他人是如何解决这个问题的 不幸的是，由于问题的性质，无法加快对随机BAM文件的排序速度。这就是为什么工具不提供多线程的原因。你可以考虑使用SAMORTORE排序而不是PICARD。您可以将多个CPU线程与samtools sort一起使用。