Ssh 配置MPI主机文件以使用多个用户标识

我想在不同的机器上运行一个带有Mpi的程序（所有带有OpenMPI 1.5的linux机器）

现在，我有可以使用

用户名A

登录的机器，还有一组可以使用

用户名B

登录的机器。所有机器都可以通过ssh访问，但我不知道如何实现这一点

我的主机文件如下所示：

localhost          #username local

machine_set_A_1    #username A
machine_set_A_2    #username A
...

machine_set_B_1    #username B
machine_set_B_2    #username B
...

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是否有可能做到这一点。谢谢。

通常，您只需在要运行mpi作业的每台计算机上安装mpi即可。然后，在mipexec调用中，您将指定标识具有mpi的主机/机器的machinefile。mpi smpd/守护进程将在每个主机上为您启动作业

例如：

 mpiexec -f machinefile -n 32 a.out

计算机文件看起来像：

 host1.some.place:16
 host2.some.place:16

这意味着两台主机各有16个核心

参考：

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我能想到的唯一方法是为您的流程启动器创建一个包装器来执行sshuser1@hostname对一些人来说，以及user2@hostname对其他人来说。您可以通过设置进程启动器ssh代理

mpirun -mca orte_rsh_agent "/path/to/mysshwrapper" -machinefile machines.txt -np 4 ./subarray

然后，您必须将适当的用户名参数从包装器注入到对ssh的调用中

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当然，您还必须设置ssh密钥，以便您登录到其他用户名帐户时无需密码。

为了解决我自己的问题，我刚刚在上找到了类似的解决方案。这可能会对您有所帮助，但这是为MPICH准备的

在具有不同用户名的计算机上使用Hydra

Hydra仅支持在某些启动器（如ssh和rsh）上使用不同的用户名。为此，主机文件应包含一个“user=”条目

一个例子

shell$ cat hosts

       donner  user=foo
       foo     user=bar
       shakey  user=bar

编辑

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有关OpenMPI，请参阅：

OpenSSH客户端支持每主机配置，类似于以下内容：

Host machine_set_A_1 machine_set_A_2 ...
User username_A

Host machine_set_B_1 machine_set_B_2 ...
User username_B

Host

指令限制以下所有声明（直到下一个

Host

指令）仅适用于与该指令后给出的任何模式匹配的主机名连接

SSH客户端配置文件通常位于

/etc/SSH/SSH\u config

（系统范围配置）和

~/.SSH/config

（用户特定配置；其中的指令覆盖系统配置中的指令）

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ssh\u config（5）

的手册页提供了关于可用关键字的更多信息，以及关于支持哪些模式的更多信息（使用类似于

Host*.groupA.uni.edu的内容，如果适用的话，可以节省一些输入）。
所有打开Mpi 1.5的linux机器，问题已更新，它将如何知道使用哪个用户在机器上执行命令？我的问题是我有不同的用户！可以创建一个SSH客户端配置文件，并使用
host
关键字指定不同的主机配置。对于每个主机，可以使用
User
关键字指定登录用户名。应该比创建包装器脚本要简单一些。@HristoIliev是的，从简单性和实用性两方面来说，这都是一个更好的答案（即使在mpirun之外，它也可能有用）。你应该把它作为一个正确的答案，而不是对这个问题的评论，这样它才能获得应有的可见性。@JonathanDursi，你的答案适用于更一般的情况，因为包装器还可以做其他不同的事情，而不仅仅是指定正确的用户名（例如，提供与SGE之类的东西的集成）。您不应该将其删除。回想起来，它似乎是黑客行为，但如果您认为它在其他情况下可能有用，我将取消删除。