有没有办法从OWL（RDF/XML）文件快速访问所有注释和子注释？

所以我在Protege中构建了一个本体，它有注释和子注释。我的意思是，一个概念可能有一个定义，这个定义可能有一个注释

所以你可能会有（s，p，o）：

我试图使用Flask应用程序使本体易于探索（我使用Python解析本体文件），但我似乎无法快速获得所有注释和子注释

我开始使用

owlready2

包，但它要求您自定义每个注释属性（您不能只获得所有注释属性的列表，因此如果您添加类似

random\u identifier

的属性，您必须返回到代码中并添加

实体。random\u identifier

或它将不会被拾取）。这工作正常，速度相当快，但子注释需要加载IRI，然后按以下方式搜索：

random_prop = IRIS['http://schema.org/fillerName']
sub_annotation = x[entity, random_prop, annotation_label]

这是非常缓慢的，需要5-10分钟来加载以搜索大约140个子注释类型，而仅注释大约需要3-5秒

从那以后，我决定放弃

owlready2

，尝试

rdflib

。然而，看起来子注释只是作为bNode附加的，我不知道如何通过它们的“父”注释访问它们，或者如果可能的话

TL；DR：有人知道如何访问条目并在XML/RDF本体文件中快速收集其所有注释和子注释吗

编辑1：

正如所建议的，以下是本体的一个片段：

    <!-- http://ncicb.nci.nih.gov/xml/owl/EVS/Thesaurus.owl#C42610 -->

    <owl:Class rdf:about="http://ncicb.nci.nih.gov/xml/owl/EVS/Thesaurus.owl#C42610">
        <rdfs:subClassOf rdf:resource="http://ncicb.nci.nih.gov/xml/owl/EVS/Thesaurus.owl#C42698"/>
        <obo:IAO_0000115 xml:lang="en">A shortened form of a word or phrase.</obo:IAO_0000115>
        <oboInOwl:hasDbXref rdf:datatype="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#anyURI">https://en.wikipedia.org/wiki/Abbreviation</oboInOwl:hasDbXref>
        <rdfs:label xml:lang="en">abbreviation</rdfs:label>
        <schema:alternateName xml:lang="en">abbreviations</schema:alternateName>
        <Property:P1036 rdf:datatype="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#integer">411</Property:P1036>
    </owl:Class>
    <owl:Axiom>
        <owl:annotatedSource rdf:resource="http://ncicb.nci.nih.gov/xml/owl/EVS/Thesaurus.owl#C42610"/>
        <owl:annotatedProperty rdf:resource="https://www.wikidata.org/wiki/Property:P1036"/>
        <owl:annotatedTarget rdf:datatype="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#integer">411</owl:annotatedTarget>
        <schema:bookEdition rdf:datatype="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#integer">20</schema:bookEdition>
    </owl:Axiom>

单词或短语的缩写形式。
https://en.wikipedia.org/wiki/Abbreviation
缩写
缩写
411
411
20

非常感谢大家

“XPath表达式”是一种指定对XML结构进行搜索的方法，可能能够完成这项工作

见：

如果您有XML结构中的数据，XPath可能会遍历树（对您来说…）并检索感兴趣的节点。

“XPath表达式”是一种指定XML结构搜索的方法，可能能够完成任务

见：

---

如果您有XML结构中的数据，XPath可能会遍历树（对您来说…）并检索感兴趣的节点。

从您的问题中，我推断“子注释”级别只有一个深度。如果是这种情况，您可以按如下方式执行SPARQL查询：

SELECT ?annProp ?annValue ?subAnn ?subValue
WHERE { 
   ?annProp a owl:AnnotationProperty .
   <the:concept> ?annProp ?annValue . 
   OPTIONAL { ?annValue ?subAnn ?subValue . }
}

SELECT？annProp？annValue？subAnn？subValue
何处{
？annProp a owl:AnnotationProperty。
？annProp？annValue。
可选{？annValue？subAnn？subValue.}
}

---

这将检索给定概念的所有注释属性及其值：：concept，并且，如果该注释具有“子注释”，它还可以检索该子注释。

根据您的问题，我推断“子注释”级别只有一个深度。如果是这种情况，您可以按如下方式执行SPARQL查询：

SELECT ?annProp ?annValue ?subAnn ?subValue
WHERE { 
   ?annProp a owl:AnnotationProperty .
   <the:concept> ?annProp ?annValue . 
   OPTIONAL { ?annValue ?subAnn ?subValue . }
}

SELECT？annProp？annValue？subAnn？subValue
何处{
？annProp a owl:AnnotationProperty。
？annProp？annValue。
可选{？annValue？subAnn？subValue.}
}

---

这将检索给定概念

的所有注释属性及其值：concept

，如果该注释有“子注释”，它也会检索该子注释。

因此我忽略了明显的。。。我将owlready2从0.18更新到了0.22，现在速度非常快。

所以我忽略了显而易见的。。。我将owlready2从0.18更新到了0.22，现在速度非常快。

这可能是一个脆弱的问题，因为OWL本体可以以多种不同的方式序列化，Protege可以在编辑本体时选择重新排序。通常，在处理OWL本体时，XML不是正确的抽象级别。这可能是一个脆弱的抽象级别，因为OWL本体可以以多种不同的方式序列化，而Protege可以在编辑本体时选择重新排序。通常，在处理OWL本体时，XML不是正确的抽象级别。在OWL2中，实体可以有两种注释：注释断言和批量注释（带有

OWL:Axiom

rdf类型的b节点），这个答案只处理第一种可能性。此外，它不考虑子注释的子注释。。。在java中，有一些API用于处理注释。有python的类似物吗？@ssz我从问题中的示例中假设OP只处理注释断言，正如我在回答中所说的：这确实假设只有一个级别的子注释，同样是因为我有OPs的印象。但是我在这里做一些猜测，因为问题中没有足够的细节。至于Python中的API：我不确定。我个人在Python中没有做过太多语义Web工作。在OWL2中，实体可以有两种注释：注释断言和批量注释（带有

owl:Axiom

rdf类型的b节点），这个答案只处理第一种可能性。此外，它不考虑子注释的子注释。。。在java中，有一些API用于处理注释。有python的类似物吗？@ssz我从问题中的示例中假设OP只处理注释断言，正如我在回答中所说的：这确实假设只有一个级别的子注释，同样是因为我有OPs的印象。但是我在这里做一些猜测，因为问题中没有足够的细节。至于Python中的API：我不确定。我个人在Python中没有做太多语义Web工作。你能从Protege生成的本体中添加一个片段来显示注释和su吗