C#。通过SFTP通过.Net应用程序上载文件时存在安全和效率漏洞

我需要的建议，从开发商谁要么面对或有经验处理类似的情况下描述如下；只是为了避免重蹈覆辙

情况：

我们有一个C#Winform应用程序，在多个站点（100+）上运行，每个站点平均每周生成30个新数据文件，每个文件的大小从10-40 MB不等。我们希望使用单向同步为字段中生成的所有数据维护一个数据存储。这是一种医疗应用，因此传输过程中数据的安全性极为重要

我们的解决方案：

由于所有新数据都是在新文件中创建的，因此我们认为基于差异的数据复制系统（如rsync）不是必需的。相反，我们正在编写一个自定义应用程序，它作为Windows服务在后台运行，并使用SFTP.Net包装器（chilkat）定期将新数据文件上载到Linux服务器。每个站点的数据都会上载到服务器上单独的预配置文件夹中。我们的自定义客户端应用程序跟踪它在本地SQLlite数据库中上载的文件。Chilkat API允许我们使用用户名/密码或密钥进行身份验证

问题:

＞P>您是否认为以上解决方案在数据传输方面容易出现安全缺陷？

您对我们的方法是否有效率方面的顾虑

有没有比我们提议的更好的替代方案。我们的客户机是Windows，服务器是基于Linux的（我们也可以移动到Windows服务器，但这肯定不是首选。）

提前谢谢

m、 乌默尔