使用awk删除字符串ID中的小数位数

我想从标识符列表中删除字符串中的小数位：

ENSG00000166224.12
ENSG00000102897.5
ENSG00000168496.3
ENSG00000010295.15
ENSG00000147533.12
ENSG00000119242.4

我期望的输出是

ENSG00000166224
ENSG00000102897
ENSG00000168496
ENSG00000010295
ENSG00000147533
ENSG00000119242

我想用awk来做，我一直在玩

printf

，但没有成功

更新：

awk答案将字段分隔符设置为

在只有一列的文件中效果很好，但是如果文件由不同的列（字符串和浮点数）组成呢？ 以下是一个例子：

ENSG00000166224.12  0.0730716237772557  -0.147970450702234
ENSG00000102897.5   0.156405616866614   -0.0398488625782745
ENSG00000168496.3   -0.110396121325736  -0.0147093758392248

如何仅删除第一个字段中的小数位

---

谢谢

您可以将字段分隔符设置为点并打印第一个元素：

$ awk -F. '{print $1}' file
ENSG00000166224
ENSG00000102897
ENSG00000168496
ENSG00000010295
ENSG00000147533
ENSG00000119242

在

sed

中，您会说

sed的/\.[^\.]*$/'文件

，它将捕获最后一个点的所有内容并将其删除

如果它只是一个数字，您就可以使用

printf

。然后，您可以使用一些不打印小数点的东西。但是，由于它是字母数字字符串，因此最好将其作为字符串处理

---

使现代化 使用

gsub

替换第一个字段中

中的所有内容：

$ awk '{gsub(/\..*$/,"",$1)}1' a
ENSG00000166224 0.0730716237772557 -0.147970450702234
ENSG00000102897 0.156405616866614 -0.0398488625782745
ENSG00000168496 -0.110396121325736 -0.0147093758392248

---

您可以将字段分隔符设置为点并打印第一个元素：

$ awk -F. '{print $1}' file
ENSG00000166224
ENSG00000102897
ENSG00000168496
ENSG00000010295
ENSG00000147533
ENSG00000119242

在

sed

中，您会说

sed的/\.[^\.]*$/'文件

，它将捕获最后一个点的所有内容并将其删除

如果它只是一个数字，您就可以使用

printf

。然后，您可以使用一些不打印小数点的东西。但是，由于它是字母数字字符串，因此最好将其作为字符串处理

---

使现代化 使用

gsub

替换第一个字段中

中的所有内容：

$ awk '{gsub(/\..*$/,"",$1)}1' a
ENSG00000166224 0.0730716237772557 -0.147970450702234
ENSG00000102897 0.156405616866614 -0.0398488625782745
ENSG00000168496 -0.110396121325736 -0.0147093758392248

同时使用子函数

awk '{sub(/\..*/, "")}1' file

同时使用子函数

awk '{sub(/\..*/, "")}1' file

---

使用

cut

：

$ cut -d. -f1 file
ENSG00000166224
ENSG00000102897
ENSG00000168496
ENSG00000010295
ENSG00000147533
ENSG00000119242

---

使用

cut

：

$ cut -d. -f1 file
ENSG00000166224
ENSG00000102897
ENSG00000168496
ENSG00000010295
ENSG00000147533
ENSG00000119242

---

如果您正在寻找perl解决方案

perl-pne的/\..*$/'file.txt

---

这最终会删除小数点后的所有内容。

如果您正在寻找perl解决方案

perl-pne的/\..*$/'file.txt

---

这最终会删除小数点后的所有内容。

谢谢@fedorqui，我会给你正确的答案，因为不同的解决方案，是的，

awk-F.{print$1}'

是一种更优雅的方式。一开始我试图发布相同的答案，但f****capatcha延迟了我的发布。如果文件有另外两个字段，并且两个字段都有浮点数，那么字段分隔符将不起作用，有没有办法将分隔符设置为字段？@user2380782不确定我是否理解你的意思。您可以发布一些示例吗？例如，一个文件带有此

ENG00000166224.12 0.0730716237772557-0.147970450702234 ENG00000102897.5 0.156405616866614-0.0398488625782745 ENG00000168496.3-0.110396121325736-0.0147093758392248

，我只对从第一个字段中删除小数感兴趣（ENSG…），带字符串的字段谢谢@fedorqui，我会给你正确的答案，因为不同的解决方案，是的，

awk-F.{print$1}

是一种更优雅的方式。一开始我试图发布相同的答案，但f****capatcha延迟了我的发布。如果文件有另外两个字段，并且两个字段都有浮点数，那么字段分隔符将不起作用，有没有办法将分隔符设置为字段？@user2380782不确定我是否理解你的意思。您可以发布一些示例吗？例如，一个文件带有此

ENG00000166224.12 0.0730716237772557-0.147970450702234 ENG00000102897.5 0.156405616866614-0.0398488625782745 ENG00000168496.3-0.110396121325736-0.0147093758392248

，我只对从第一个字段中删除小数感兴趣（ENSG…），带字符串的字段