awk比较文件，在不匹配的情况下插入字符

我有两个以制表符分隔的文件

pos.txt

A   100027454       
A   100028517       
A   100028954       
A   100028986       
A   100033307       
A   100033331       
A   100033338       
A   100033382       
A   100033410       
A   100033424       

及

file1.txt

A   102470  T       *
A   102471  G       *
A   102472  C       *
A   102473  T       *
A   102474  G       *
A   102475  G       *
A   102476  T       *
A   102477  C       *
A   102478  C       *
A   102479  T       *

我想根据第一个文件中的第二列比较这两个文件。如果第二列值存在于两个文件的一行中，我希望它在第二个文件中输出整行。如果该值出现在第一个文件中，而不是第二个文件中，我希望它在第四列和前三列按原样输出一个X

这是我所能做到的：

awk 'FNR==NR{a[$2]++;next}a[$2]' pos.txt file1.txt

---

但这只打印在文件1中找到的第2列值。我不希望这些值丢失。

这将满足您的需要：

$ awk 'FNR==NR{a[$2]++;next}a[$2]{$4="\tx";print;next}1' pos.txt file1.txt

---

嘿这在逻辑方面有很大帮助，但代码并不能完全满足我的需要。我需要它只为pos.txt中的列值打印X我不希望它打印文件1中的所有内容。txt您可以添加所需的输出以补充您的问题描述吗？第一个文件中没有第四列，所以您尝试使用第四列中的X输出的确切内容是什么？为什么不举一个例子，说明pos.txt中的一些字段与相关的期望输出不匹配？这将有助于澄清您的需求相当多-现在它是完全模糊的。即使将第一个文件命名为pos.txt，将第二个文件命名为file1，而不是简单地命名为file1和file2，也会让人感到困惑。把你的问题说得清楚简单。