Awk 如何在文本文件中将列分隔为两个以制表符分隔的列

我有一个有5列的输入文件，但是我需要将第5列分成两列，这样输出文件总共有6列

我的输入文件数据如下所示：

chrX    100629986   100630758   -   ENSG00000000003.14.IntrontENST00000373020.8.Intron  
chrX    100630866   100632484   -   ENSG00000000003.14.IntrontENST00000373020.8.Intron  
chrX    100632568   100633404   -   ENSG00000000003.14.IntrontENST00000373020.8.Intron

您注意到，第5列在我的所有数据中都具有类似的结构，因此我要做的是使第5列包含“ENSG00000000003.14.Intron”，而第6列包含“tenst0000373020.8.Intron”

但是，并非所有我的数据都有.Intron标记，例如：

chrX    100597503   100597531   +   ENSG00000000005.5tENST00000485971.1

但是你会注意到我所有的数据都是“t”，因此我想用它来分隔这些列。我不确定如何对有几十万行的数据执行此操作，手动执行此操作将花费很长时间。我还需要将整个文件用制表符分隔，以便继续进一步处理这些数据

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多亏了大家，您可以使用sed插入选项卡：

sed 's/tENST/\t&/' < input > output

sed's/tENST/\t&/'output

每个tENST字符串都由一个制表符+字符串替换

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对于某些

sed

版本，您可以尝试使用

$'s/tENST/\t&/'

（即，在

$

前加一个前缀）。

您可以使用sed插入选项卡：

sed 's/tENST/\t&/' < input > output

sed's/tENST/\t&/'output

每个tENST字符串都由一个制表符+字符串替换

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对于某些

sed

版本，您可以尝试使用

$的/tENST/\t&/'

（即，在

$

前加一个前缀）。

使用awk，您可以编写

awk -F"\t" '{sub(/tENST/, FS "tENST", $5); print}' file > output

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有了awk，你就可以写作了

awk -F"\t" '{sub(/tENST/, FS "tENST", $5); print}' file > output

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“t”字符是否存在于文件中的其他位置？它的前面总是ENSG+数字和点吗？在单词“Intron”（有时是原始帖子中第5列中某些行的后缀）之外，则不是。是的，“t”后面总是ENST+什么吗？是的，总是ENST，后面是数字的一些变体。“t”字符是否存在于文件的其他地方？它的前面总是ENSG+数字和点吗？在单词“Intron”（有时是原始帖子中第5列中某些行的后缀）之外，则不是。是“t”总是跟在ENST+后面吗？是的，总是ENST，然后是数字的一些变化。输出以下内容：chrX 100629986 100630758-ENSG0000000003.14.IntronttENST00000373020.8.Intron chrX 100630866 100632484-ENSG0000000003.14.IntronttENST00000373020.8.IntronchrX 100632568 100633404-ENSG0000000003.14.IntronttENST00000373020.8.Intron编辑：Yikes不知道如何格式化注释中的代码。@系统：您使用的是什么操作系统？是否需要更新Mac OS X版本10.9.5？整个实验室都在使用mac电脑，所以未经PI许可，我不允许进行任何更新，而他一整天都在外面。哇，这真让人尴尬。这工作完美无瑕，谢谢！我已经接受了答案！：）输出以下内容：chrX 100629986 100630758-ensg0000000003.14.introntenst0000373020.8.Intron chrX 10063086100632484-ensg0000000003.14.introntenst0000373020.8.Intron chrX 100632568 100633404-ensg0000000003.14.introntenst000037300.8.Intron编辑：Yikes不知道如何在注释。@系统：您使用的是什么操作系统？Mac OS X版本10.9.5是否需要更新？整个实验室都在使用mac电脑，所以未经PI许可，我不允许进行任何更新，而他一整天都在外面。哇，这真让人尴尬。这工作完美无瑕，谢谢！我已经接受了答案！：）正如你所看到的，只有一个被接受的答案是可能的，而乔洛巴的答案是更好的。正如你所看到的，只有一个被接受的答案是可能的，而乔洛巴的答案是更好的。