具有awk和执行顺序的多个过程

问题分两部分：

第一部分： 首先我有一个序列AATTCCGG，我想把它改成TAAGGCC。我使用gsub将A更改为T，C更改为G，G更改为C，T更改为A。不幸的是，awk按顺序执行这些命令，因此我最终使用AAACCCC。我通过使用大写和小写来解决这个问题，然后将其转换回大写值，但如果可能的话，我希望在一个步骤中完成这项工作

例如：

echo AATTCCGG | awk '{gsub("A","T",$1);gsub("T","A",$1);gsub("C","G",$1);gsub("G","C",$1);print $0}'

输出： AACCC

第二部分： 在启动第二组指令之前，有没有办法让awk运行到一组指令的文件末尾？我尝试了下面的一些方法，但没有成功

对于数据集

1 A
2 B
3 C
4 D
5 E

我正在使用下面的管道获取我想要的数据（只是一个示例）

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我正在使用管道重新运行程序，但是我发现如果不必重新运行程序，速度会更快。

这可以通过

tr

有效解决：

$ echo AATTCCGG | tr ATCG TAGC

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关于第二部分（这应该是一个不同的问题）：不，使用awk是不可能的，管道就是出路。

对于第二部分，请尝试以下命令：

awk '{if ($1%2==0)print $1,"E"}' test 

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下面是我使用awk为问题的第一部分找到的一种方法。它使用数组和for循环

cat sub.awk
awk '
        BEGIN{d["G"]="C";d["C"]="G";d["T"]="A";d["A"]="T";FS="";OFS=""}
        {for(i=1;i<(NF+1);i++)
                {if($i in d)
                        $i=d[$i]}
                                }
        {print}'

Input/Output:
ATCG
TAGC

cat sub.awk
awk'
开始{d[“G”]=“C”；d[“C”]=“G”；d[“T”]=“A”；d[“A”]=“T”；FS=”“；OFS=”“}
{for（i=1；i
cat sub.awk
awk '
        BEGIN{d["G"]="C";d["C"]="G";d["T"]="A";d["A"]="T";FS="";OFS=""}
        {for(i=1;i<(NF+1);i++)
                {if($i in d)
                        $i=d[$i]}
                                }
        {print}'

Input/Output:
ATCG
TAGC