Awk 如何比较头文件（fasta）的一部分并将其放在一起？

我在一个目录中有更多的

fasta

文件，它们的开头相同，但结尾不同：

file1abgff
-----------

file2adferr
------------

file3adfr
----------

file1adcef
-----------

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如何将目录中所有文件的开头相互比较，并将匹配项组合到一个新文件中（

example>file1abgfadcef

）？

此代码似乎可以解决您的问题

假设您有输入文件：

cat input
>file1abgff
>file2adferr
>file3adfr
>file1adcef

以下是我的解决方案：

 sed 's/[0-9]/& /' input | awk  '{a[$1]=($1 in a ? a[$1]"|"$2 : $0)}END{for (i in a){print a[i]}}' | sed 's/ //' | grep  "|" | sed 's/|//'

>file1abgffadcef

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需要向OP提供更多信息，以便人们能够帮助您。提供几个带有有效标题的示例文件，以及您希望如何获得输出。您提供的示例没有帮助！当你使用awk时，你永远不需要sed，当你使用任何一个（谷歌UOOC）时，你永远不需要cat。嗨，宝贝和@EdMorton，我改进了我的解决方案。嗨，银杏，谢谢你的回答！但这不起作用。有了这段代码，我就有了输出：>file3adfradfr也许任何人都有办法帮助我，我试着用另一种方式：#/对于i in*，bin/bash TESTCHARS=6；为j英寸*；如果[[

head-c$TESTCHARS“$i”

=

head-c$TESTCHARS“$j”

]，则执行此操作；然后cat i j>/combinedfile.fasta#此部分在退出0时不起作用