Bash 将参数附加到文件中的命令，然后运行附加的命令

我在一个名为

$stat\u val\u result\u command

的文件中使用了以下命令。 我想在文件末尾添加

-Xms1g

参数，以便如下所示：

  <my command in the file> -Xms1g

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最好避免附加或操作workdir中本地化的输入文件，因为这些文件可能是原始文件的符号链接，并且默认情况下是原始文件的符号链接

在您的情况下，考虑导出环境变量。这可能适用于您，也可能不适用于您，但如果您能够控制脚本的生成方式，则可能会给您一些想法：

export JAVA_TOOL_OPTIONS="-Xms1g"
bash "${stat_val_result_command}"

另外，通常最好避免像这样本地化和运行脚本。这可能是不可避免的，但通常有更好的选择。例如，可以更简单地处理Bash脚本：

授予这些文件的执行权限，并将其复制到 项目存储库根目录中名为

bin/

的文件夹。 Nextflow将自动将此文件夹添加到

路径

环境中 变量，并且脚本将在您的 管道，无需指定调用它们的绝对路径

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当然，这假设您可以控制和参数化创建Bash脚本的过程。

三重引号是什么？Bash将三个backtick与一个完全相同，只是执行起来比较慢，因为它是一个空对（打开/关闭），然后是一个包含内容的对，然后是另一个空对（打开/关闭）。所有这些对都会产生子shell，包括空的子shell。除此之外，

$（cat anything）

（或其backtick等价物）具有中讨论的错误，因为命令替换的结果与参数扩展的结果以相同的方式进行解析。如果文件是正常的unix文本文件格式，

echo“-Xms1g”>>文件

将向文件中添加新行，而不是添加到已存在的行中。这可能不重要，因为您使用文件的方式不同，但我仍然会检查文件，看看是否发生了这种情况。@Gordan我如何才能添加到同一行？添加后如何在bash中运行它？能否将该文件设置为常规shell脚本，并将

-Xms1g

作为参数传递给它（并让脚本使用例如

commandorun“$@”

传递参数）？

export JAVA_TOOL_OPTIONS="-Xms1g"
bash "${stat_val_result_command}"