system（）：为什么在EMACS中使用R时，我没有与在bash终端中相同的权限？ 更新：该错误仅在从emacs内登录到R时发生 工作原理：

当我ssh到远程服务器并运行

$ ./foo.rb

在bashshell中，它可以工作。此外，如果我启动R并执行 $R

系统（'./foo.rb'）

---

我所在的小组有权读取/写入/执行该文件。文件权限为

-rwxrwx---

什么不起作用： 启动emacs并启动R会话：

• M-xr

• ssh myserver:

  系统（'./foo.rb'）

我得到以下错误：

ruby: Permission denied -- foo.rb (LoadError)

为什么会这样？有办法解决这个问题吗

我在

？系统

或

？系统2

中找不到任何信息

---

以下是sessionInfo（）的输出

---

根据@sarnold的注释，从ssh和emacs输出'id'和'env'（更改的用户名、组名和ip地址） 1.服务器 1.1“身份证” 1.2“环境” emacs/ess R会议 2.1系统（id） 2.2系统（“环境”）

---

假设您以同一用户的身份启动了R，那么您可以。但是，您的错误并非来自

foo.rb

的权限问题，否则您的shell将给出错误。（即

sh:./test.rb:权限被拒绝

；参见下面的示例）。在这里，ruby本身给出了错误。在不确切知道您的

foo.rb

中有什么内容的情况下，我建议深入其中查看它试图加载/源代码的内容，并检查这些内容的权限

#/usr/bin/env ruby
把“你好，世界”

现在在R

> system('ls -l test.rb')
-rw-r--r--  1 jcolby  staff  40 Oct 21 08:23 test.rb
> system('./test.rb')
sh: ./test.rb: Permission denied
> system('chmod a+x test.rb')
> system('./test.rb')
Hello world

---

我假定Emacs派生输出中的

M模块路径

只是一个复制粘贴输入错误

两个

env

输出之间的差异比我预期的要大得多；我选择了一些我觉得有点可疑的：

$ diff -u works fails
--- works   2011-10-24 15:04:02.000000000 -0700
+++ fails   2011-10-24 15:12:36.000000000 -0700
...
+LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib64/R/lib:/usr/local/lib64:/usr/lib/jvm/jre/lib/amd64/server:/usr/lib/jvm/jre/lib/amd64:/usr/lib/jvm/java/lib/amd64:/usr/java/packages/lib/amd64:/lib:/usr/lib
...
-PATH=/usr/kerberos/bin:/usr/local/bin:/bin:/usr/bin:/opt/dell/srvadmin/bin
-PWD=/home/dleb
...
+PATH=/bin:/usr/bin:/usr/sbin:/usr/local/bin
...
+PWD=/home/a-m/dleb/pecan
...

在emacs派生会话中，您的

LD\u LIBRARY\u PATH

环境变量可能正在更改执行

ruby

时使用的动态链接库的具体信息。如果您

ssh

进入您的服务器，并使用更改的

LD\u LIBRARY\u路径执行
foo.rb
，它是工作还是失败

LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib64/R/lib:/usr/local/lib64:/usr/lib/jvm/jre/lib/amd64/server:/usr/lib/jvm/jre/lib/amd64:/usr/lib/jvm/java/lib/amd64:/usr/java/packages/lib/amd64:/lib:/usr/lib ./foo.rb

两个会话之间的
PATH
环境变量不同；也许您有权执行
/usr/local/bin/ruby
（或
/usr/local/lib/ruby/
中的库），但没有
/usr/bin/ruby
（或
/usr/lib/ruby/
中的库）。您的脚本是否使用
#！env ruby
还是使用
#/usr/bin/ruby
（或其他固定路径）

您的
pwd
在一个实例中是
/home/dleb
，另一个
/home/a-m/dleb/pecan
——但是
home
在两个系统上都设置为
/home/a-m/dleb
。
/home/dleb
是一个符号链接，还是它实际上与
/home/a-m/dleb
分开存在？（这确实是在抓救命稻草——我不认为是这样，但这个问题令人困惑。）

最后要考虑的一点是：您的服务器是否受限于诸如、或之类的工具？这些工具中的任何一个都可以防止应用程序在特定位置写入，可能它们还没有为您的站点配置。检查
dmesg（1）
输出以查看是否有任何拒绝消息，如果
auditd（8）
未运行，则大多数或所有这些工具都会登录到
dmesg（1）
。
明显的问题：文件是否每个人都可以执行？也就是说，确切的权限是什么？权限是
-rwxrwx--
，我已经更新了问题，好的，所以不是每个人都可以执行。如果将文件权限设置为
-rwxrwx--x
，是否有效？如果是这样，运行R的用户可能不在具有执行权限的组中。foo.rb做什么？ruby中的一个简单hello world在系统中为我工作，即使有这些权限。我怀疑ruby正在做一些事情，所以答案将是特定于其中发生的任何事情……此外，请尝试system（“id”）查看它认为您是什么id。可能有人安装了R来运行setuid，或者其他人。。。或者运行系统（“sh”）并从该外壳中尝试您的ruby谢谢您的回答。我不知道为什么，但这个错误只发生在emacs内部。尽管如此，您的测试脚本仍然运行良好（我既是所有者又是团队成员）。啊，至少可以排除一些事情。我不知道emacs，但我相信有人会想出点子。也许可以调整你的标题以吸引更多emacs的注意？
uid=1668(dleb) gid=1668(dleb) groups=117(ebusers),159(lab_admin),166(lab),1340(pal_web),1668(dleb)

LN_S=ln -s
R_TEXI2DVICMD=/usr/bin/texi2dvi
LC_PAPER=en_US.UTF-8
SED=/bin/sed
LC_ADDRESS=en_US.UTF-8
R_PDFVIEWER=/usr/bin/xdg-open
LC_MONETARY=en_US.UTF-8
HOSTNAME=ebi-forecast
R_INCLUDE_DIR=/usr/include/R
R_PRINTCMD=lpr
SHELL=/usr/local/bin/system-specific
TERM=dumb
AWK=gawk
HISTSIZE=1
R_RD4DVI=ae
SSH_CLIENT=888.888.888.88 51159 22
KDE_NO_IPV6=1
R_RD4PDF=times,hyper
R_PAPERSIZE=a4
NCARG_FONTCAPS=/usr/lib64/ncarg/fontcaps
PERL=/usr/bin/perl
LC_NUMERIC=en_US.UTF-8
SSH_TTY=/dev/pts/14
LC_ALL=C
EMACS=t
USER=dleb
LC_TELEPHONE=en_US.UTF-8
LS_COLORS=
LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib64/R/lib:/usr/local/lib64:/usr/lib/jvm/jre/lib/amd64/server:/usr/lib/jvm/jre/lib/amd64:/usr/lib/jvm/java/lib/amd64:/usr/java/packages/lib/amd64:/lib:/usr/lib
TAR=/bin/gtar
ENV=
R_ZIPCMD=/usr/bin/zip
KDEDIR=/usr
PAGER=/usr/bin/less
NCARG_GRAPHCAPS=/usr/lib64/ncarg/graphcaps
R_GZIPCMD=/usr/bin/gzip
PATH=/bin:/usr/bin:/usr/sbin:/usr/local/bin
LC_COLLATE=en_US.UTF-8
LC_IDENTIFICATION=en_US.UTF-8
EGREP=/bin/grep -E
PWD=/home/a-m/dleb/pecan
INPUTRC=/etc/inputrc
R_LIBS=/home/a-m/dleb/lib/R
NCARG_ROOT=/usr
R_SHARE_DIR=/usr/share/R
WHICH=/usr/bin/which
EDITOR=vi
LANG=en_US.UTF-8
KDE_IS_PRELINKED=1
R_LIBS_SITE=/usr/local/lib/R/site-library:/usr/local/lib/R/library:/usr/lib64/R/library:/usr/share/R/library
M    ODULEPATH=/usr/share/Modules/modulefiles:/etc/modulefiles
NCARG_DATABASE=/usr/lib64/ncarg/database
LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8
LOADEDMODULES=
PS3=
R_BROWSER=/usr/bin/xdg-open
SSH_ASKPASS=/usr/libexec/openssh/gnome-ssh-askpass
NCARG_LIB=/usr/lib64/ncarg
HOME=/home/a-m/dleb
SHLVL=1
NCARG_NCARG=/usr/share/ncarg
R_ARCH=
TR=/usr/bin/tr
MAKE=make
R_UNZIPCMD=/usr/bin/unzip
LOGNAME=dleb
CVS_RSH=ssh
LC_CTYPE=en_US.UTF-8
SSH_CONNECTION=888.888.888.88 51159 999.999.999.99 22
R_BZIPCMD=/usr/bin/bzip2
MODULESHOME=/usr/share/Modules
LESSOPEN=|/usr/bin/lesspipe.sh %s
PROMPT_COMMAND=
R_HOME=/usr/lib64/R
DISPLAY=localhost:22.0
R_PLATFORM=x86_64-redhat-linux-gnu
INSIDE_EMACS=23.2.1,tramp:2.1.18-23.2
R_LIBS_USER=~/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/2.12
LC_TIME=en_US.UTF-8
R_DOC_DIR=/usr/share/doc/R-2.12.2
R_SESSION_TMPDIR=/tmp/RtmpqA6bpJ
HISTFILE=/home/a-m/dleb/.tramp_history
G_BROKEN_FILENAMES=1
LC_NAME=en_US.UTF-8
_=/bin/env

> system('ls -l test.rb')
-rw-r--r--  1 jcolby  staff  40 Oct 21 08:23 test.rb
> system('./test.rb')
sh: ./test.rb: Permission denied
> system('chmod a+x test.rb')
> system('./test.rb')
Hello world

$ diff -u works fails
--- works   2011-10-24 15:04:02.000000000 -0700
+++ fails   2011-10-24 15:12:36.000000000 -0700
...
+LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib64/R/lib:/usr/local/lib64:/usr/lib/jvm/jre/lib/amd64/server:/usr/lib/jvm/jre/lib/amd64:/usr/lib/jvm/java/lib/amd64:/usr/java/packages/lib/amd64:/lib:/usr/lib
...
-PATH=/usr/kerberos/bin:/usr/local/bin:/bin:/usr/bin:/opt/dell/srvadmin/bin
-PWD=/home/dleb
...
+PATH=/bin:/usr/bin:/usr/sbin:/usr/local/bin
...
+PWD=/home/a-m/dleb/pecan
...

LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib64/R/lib:/usr/local/lib64:/usr/lib/jvm/jre/lib/amd64/server:/usr/lib/jvm/jre/lib/amd64:/usr/lib/jvm/java/lib/amd64:/usr/java/packages/lib/amd64:/lib:/usr/lib ./foo.rb