Bash 基于数组将文件拆分为不同的文件

我有一个文件如下所示：

1   10000   10400   GI.STMC.GAST-EnhA
1   10000   10400   SKIN.PEN.FRSK.FIB.02-EnhA 
1   10000   10400   BRN.DL.PRFRNTL.CRTX-EnhA
1   10000   10400   BRN.ANT.CAUD-EnhA
1   10000   10400   HRT.ATR.R-EnhA 
1   10200   10400   ESDR.H1.MSC-EnhA
1   10200   10400   GI.ESO-EnhA
1   10200   10400   GI.DUO.SM.MUS-EnhA
1   10200   10400   LNG-EnhA
1   14800   15200   MUS.TRNK.FET-EnhA

我想根据第4列中的注释拆分文件，我可以使用以下代码提取唯一的注释：

sort -u file.list > annotation.list # file.list file with the different annotations

我可以将注释中的信息存储在一个数组中：

 mapfile -t myARRAY < annotation.list,

我可能

grep

独特的注释并将其输出到文件，但我相信这可能是一种最优雅的方式

谢谢

编辑：到目前为止，我有这个

mapfile -t myARRAY < annotation.list;
for ann in ${myARRAY}; do
     grep ${ann} roadmap.core_active.bed > ${ann}.annotation
done

mapfile-t myARRAY${ann}.annotation
完成

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但是，我只做了一个注释

这将创建您要求的每个注释文件：

awk '{print >$4".annotation"}' file.list

Awk隐式地逐行读取文件。这里，我们使用一个

print

语句，其输出被重新定向到一个文件，该文件的名称由第四个字段组成，并添加了后缀

.annotation

除非有大量不同的注释，否则上述方法将起作用。在这种情况下，您可能会达到打开文件的系统限制。为了避免这种情况，我们需要显式关闭文件：

awk '{fname=$4".annotation"; print>fname; close(fname)}' file.list

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按如下方式修复您的循环：“${myARRAY[@]}”中ann的

；执行…

awk '{fname=$4".annotation"; print>fname; close(fname)}' file.list