将双循环并行化为数组作业（Matlab+；bash）
我在Matlab中有一个双循环。我希望您能帮助我将其作为数组作业与bash文件在我所在大学的HPC中进行并行处理 重要1：我无法使用parfor，因为我没有Matlab并行工具箱 重要提示2：请不要太注意代码的内容。这是一个愚蠢的例子，显然不需要任何并行化。我的实际代码要复杂得多，我不能在这里报告。我可以向您保证，对于我的具体情况，将并行化作为阵列作业是最有效的解决方案将双循环并行化为数组作业（Matlab+；bash）,bash,matlab,Bash,Matlab,我在Matlab中有一个双循环。我希望您能帮助我将其作为数组作业与bash文件在我所在大学的HPC中进行并行处理 重要1：我无法使用parfor，因为我没有Matlab并行工具箱 重要提示2：请不要太注意代码的内容。这是一个愚蠢的例子，显然不需要任何并行化。我的实际代码要复杂得多，我不能在这里报告。我可以向您保证，对于我的具体情况，将并行化作为阵列作业是最有效的解决方案 这是我想并行化的原始Matlab文件 clear rng default m=4; n=2; A=randn(m,n);
这是我想并行化的原始Matlab文件
clear
rng default
m=4;
n=2;
A=randn(m,n);
g=5;
B=randn(g,n);
result=cell(m,1);
for i=1:m %LOOP 1
result{i}=zeros(g,n);
for h=1:g %LOOP 2
result{i}(h,:)=A(i,:)+B(h,:);
end
end
我知道如何将外部循环（循环1）作为阵列作业并行化。我可以这样做 1）文件main.m
clear
rng default
m=4;
n=2;
A=randn(m,n);
g=5;
B=randn(g,n);
workers=m; %number of parallel workers
jobs=1; %number of jobs per parallel worker
%% Select local part of A
idtemp=str2double(getenv('SGE_TASK_ID'));
A_local=A(jobs*(idtemp-1)+1: idtemp*jobs,:);
%% Do the job
result=zeros(g,n);
for h=1:g
result(h,:)=A_local+B(h,:);
end
%% Save the job
filename = sprintf('result.%d.mat', ID);
save(filename,'result')
clear
rng default
m=4;
n=2;
A=randn(m,n);
g=5;
B=randn(g,n);
workers=m; %number of parallel workers
jobs=1; %number of jobs per parallel worker
%% Select local part of A
idtemp=str2double(getenv('SGE_TASK_ID'));
A_local=A(jobs*(idtemp-1)+1: idtemp*jobs,:);
%% Do the job
result=zeros(g,n);
for h=1:g
result(h,:)=A_local+B(h,:);
end
%% Save the job
filename = sprintf('result.%d.mat', ID);
save(filename,'result')
#$ -S /bin/bash
#$ -l h_vmem=3G
#$ -l tmem=3G
#$ -l h_rt=480:0:0
#$ -cwd
#$ -j y
#Run 4 tasks where each task has a different $SGE_TASK_ID ranging from 1 to 4
#$ -t 1-4
#$ -N example
date
hostname
#Output the Task ID
echo "Task ID is $SGE_TASK_ID"
/share/apps/matlabR2018b/bin/matlab -nodisplay -nodesktop -nojvm -nosplash -r "main; ID = $SGE_TASK_ID; f_s; exit"
f_.mPARFORparforparforparforparforOptionsPARFORparforparforparforparforOptionsparforparforparforparfor