Bioinformatics 用于读取和操作BAM和VCF文件的推荐语言？_Bioinformatics_Samtools_Bcftools_Bam_Vcf Variant Call Format

Bioinformatics 用于读取和操作BAM和VCF文件的推荐语言？

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我通常是一名C#/.net开发人员，但一个新项目将使用下一代测序BAM和VCF文件。我需要读取这些文件，进行一些更改，然后保存它们。据我所知，现有的.net库没有太多的方法来处理这些文件

该领域通常使用哪些编程语言，并且有支持这些文件的库？

Python以及pysam和pyvcf库。

或者将shell与samtools、sambamba、vcflib、vcftools、bcftools和许多其他命令行实用程序一起使用。您可以使用bioconda安装其中许多

java:htsjdk库、C/C++htslib、python:pysam等。。。对于生物信息学，您可以询问：