通过cygwin命令安装bedtools时出错：致命错误：zlib.h:没有此类文件或目录

我正试图通过Cygwin安装v2.27.0。以下是我尝试过的命令：

$ wget https://github.com/arq5x/bedtools2/releases/download/v2.27.0/bedtools-2.27.0.tar.gz
$ tar -zxvf bedtools-2.27.0.tar.gz
$ cd bedtools2
$ make

运行最后一个命令时，出现以下错误：

*fatal error: zlib.h: No such file or directory  
*#include <zlib.h>*  
^  
compilation terminated.  
make[1]: *** [Makefile:37: ../../../obj//FileRecordMgr.o] Error 1  
make: *** [Makefile:187: src/utils/FileRecordTools] Error 2*  

Unable to locate package libz-dev

但它不起作用。我得到了以下错误：

*fatal error: zlib.h: No such file or directory  
*#include <zlib.h>*  
^  
compilation terminated.  
make[1]: *** [Makefile:37: ../../../obj//FileRecordMgr.o] Error 1  
make: *** [Makefile:187: src/utils/FileRecordTools] Error 2*  

Unable to locate package libz-dev

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注意，我在windows（64位机器）上使用Cygwin终端。非常感谢您的帮助。

要安装软件包，请使用安装程序中的

cygwin

，或者在使用

apt cyg

要查找包含zlib.h标头的包，请执行以下操作：

$ cygcheck -p include/zlib.h
Found 10 matches for include/zlib.h
...
zlib-devel-1.2.11-1 - zlib-devel: gzip de/compression library (development)
..

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所以您需要安装

zlib-devel

谢谢…这很有用！我下载了zlib-devel，它部分起作用。但是，我遇到了另一个错误：coverageFile.cpp:在成员函数“virtual void coverageFile:：giveFinalReport（RecordOutputMgr*）”中：coverageFile.cpp:100:46:错误：“asprintf”未在此范围内声明为asprintf（&depthPctString，“%0.7f”，depthPct）；我尝试查找asprintf，但找到0个匹配项！感谢您的帮助。

asprintf

在标题中声明。它应该在

stdio.h

内。未在此范围内声明的

表示编译器调用限制了声明的可见性。通常是由于

-std=c99

或类似原因。检查完整日志以获取提示