Docker 如何将singularity自动生成的文件输出到宿主当前目录？_Docker_Singularity Container

Docker 如何将singularity自动生成的文件输出到宿主当前目录？

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Docker 如何将singularity自动生成的文件输出到宿主当前目录？,docker,singularity-container,Docker,Singularity Container,在下面的singularity运行中，我将主机目录$wkdir绑定为容器的/wkdir #!/bin/bash sif=/mnt/data1/workspace/dz33/cellranger/build/cellranger-4.0.0.sif wkdir=/mnt/data1/workspace3 singularity exec -B ${wkdir}:/wkdir ${sif} cellranger mkfastq \ --id=siftest \ --run=/wkd

在下面的singularity运行中，我将主机目录

$wkdir

绑定为容器的

/wkdir

#!/bin/bash

sif=/mnt/data1/workspace/dz33/cellranger/build/cellranger-4.0.0.sif
wkdir=/mnt/data1/workspace3
singularity exec -B ${wkdir}:/wkdir ${sif} cellranger mkfastq \
    --id=siftest \
    --run=/wkdir/data/abc \
    --samplesheet=/wkdir/data/samples.csv \
    --output-dir=/wkdir/container_test

但是，除了主输出之外，程序会自动在容器的根目录中生成一些directore，并生成一些中间文件，这些文件会由于写入权限而导致错误。我想知道如何将这些自动生成的文件和目录输出到主机当前目录