For loop If运算符在for循环中

我有如下的输入文件，需要对每3列三元组执行此转换

col1*0+col2*1+col3*2

input.txt-所有正数都可以是小数，实际文件有1000列

0 0 0 1 0 0
0 1 0 0 0 1
0 0 1 0 0 0

我有下面这句话：

gawk '{for(i=1;i<=NF;i+=3)x=(x?x FS:"")(($(i+1))+($(i+2)*2));print x;x=y}' input.txt
0 0
1 2
2 0

预期产出：

-9 0
1 2
2 -9

数据描述：

---

该数据由软件输出——基因型插补和单倍型分阶段程序。行是示例，列是示例。每个SNP由3列表示。每个SNP有3个数量，范围为0-1（等位基因AA-AB-BB的概率）。在上面的例子中，我们有3个SNP和2个样本。插补也可以表示为剂量值，每个SNP 1个数字，范围为0-2。我们正试图将概率形式转换成剂量形式。当IMPUTE2不能为任何等位基因提供任何概率时，它输出为

0 0

，然后我们应该转换为no call

-9

如果三个给定列为

0

，则希望总和不同。为此，可以将三元运算符展开为>

gawk '{ for(i=1;i<=NF;i+=3) {
          x=$(i+1) + $(i+2)*2;   # the sum
          res=res (res ? FS : "") ($i==0 && $(i+1)==0 && $(i+2)==0 ?-9:x)
        }
       print res; res=""         # print stored line and empty for next loop
      }' file

如果所有值均为正值，则可以重新格式化检查，以便仅比较总和是否为

0

($i + $(i+1) + $(i+2)) ? x : -9

使用您的文件进行测试显然有效：

$ gawk '{for(i=1;i<=NF;i+=3) {x=$(i+1) + $(i+2)*2; res=res (res ? FS : "") ($i==0 && $(i+1)==0 && $(i+2)==0 ?-9:x)} print res; res=""}' file
-9 0
1 2
2 -9

---

$gawk'{for（i=1；i另一个
awk
一个线性（假设输入值为非负）

所以如果你只是乘以零，那么忽略第1列和第4列是安全的，对吗？@ghoti是的，我在现有的gawk解决方案中也忽略了它们。
$（I+1））+（$（I+2）*2
我还没有测试它，如果实际数据中的列数是1000，这会起作用吗？另外，不要依赖于假设
c1 | |$1
等于零意味着$1、$2、$3都是零。例如，$2==2和$3==-1意味着结果是合法的零。是的，零测试用于零或其他。计算值使用两个字段和”“或者"使用未使用的字段填充将指示所有字段是零还是任何非零。假设数据是非负值，我以为已指定，但不再确定。非负值已从规范中编辑掉！如果可以使用负值，则不正确，因为它们可能相互抵消。这不是仅为ini设置的循环构造tial 6列。该逻辑仅适用于非负值。能否在第3行添加更多详细信息？什么是
？
意思？@zx8754
var=condition？“如果为真”：“如果为假”
是三元运算符。例如，您可以说
x=（var>0）？var:-var
使
x
包含
var
无符号。谢谢，将
$i==0&&$（i+1）==0&&$（i+2）==0
转换为
$（$i+$（i+1）+$（i+2））==0
会更有效吗？（取总和并检查是否为0）。@zx8754如果所有正数都是，但如果
$i==1
，
$i+1怎么办==0
和
$（i+2）==-1
？总和是0，而两个不是。@zx8754没问题！刚刚更新了我的答案，考虑到了这一点。
($i + $(i+1) + $(i+2)) ? x : -9

$ gawk '{for(i=1;i<=NF;i+=3) {x=$(i+1) + $(i+2)*2; res=res (res ? FS : "") ($i==0 && $(i+1)==0 && $(i+2)==0 ?-9:x)} print res; res=""}' file
-9 0
1 2
2 -9

$ awk '{c1=$2+2*$3;c2=$5+2*$6; print c1||$1?c1:-9,c2||$4?c2:-9}' lop
-9 0
1 2
2 -9