在PGI Fortran中分配大数组

在PGI Fortran中分配大数组,fortran,Fortran,我试图在Fortran中分配一个实数组finn_var(459299,27,24,nspec)。nspec=24正常工作,而nspec=25不正常。分配过程没有错误消息,但print命令print为空而不是零值。如果使用数组,将出现“分段错误”错误消息。测试程序是 program test implicit none integer :: nx, ny, nez, nt, nspec integer

我试图在Fortran中分配一个实数组finn_var(459299,27,24,nspec)。nspec=24正常工作,而nspec=25不正常。分配过程没有错误消息,但print命令print为空而不是零值。如果使用数组,将出现“分段错误”错误消息。测试程序是

  program test

  implicit none

  integer                    :: nx, ny, nez, nt, nspec
  integer                    :: allocation_status
  real , allocatable         :: finn_var(:,:,:,:,:)

  nx    = 459
  ny    = 299
  nez   = 27
  nt    = 24
  nspec = 24

  allocate( finn_var(nx, ny, nez, nt, nspec), stat = allocation_status )
  if (allocation_status > 0) then
    print*, "Allocation error for finn_var"
    stop
  end if

  print*, finn_var

  end
不应该是内存问题。我毫无问题地分配了双精度finn_var(459299,27,24,24)。那么原因是什么呢

我在linux服务器上使用pgf90。cat/proc/meminfo命令:

MemTotal:     396191724 kB
MemFree:      66065188 kB
Buffers:        402388 kB
Cached:       274584600 kB
SwapCached:          0 kB
Active:       131679328 kB
Inactive:     191625200 kB
HighTotal:           0 kB
HighFree:            0 kB
LowTotal:     396191724 kB
LowFree:      66065188 kB
SwapTotal:    20971484 kB
SwapFree:     20971180 kB
Dirty:          605508 kB
Writeback:           0 kB
AnonPages:    48317148 kB
Mapped:         123328 kB
Slab:          6612824 kB
PageTables:     132920 kB
NFS_Unstable:        0 kB
Bounce:              0 kB
CommitLimit:  219067344 kB
Committed_AS: 53206972 kB
VmallocTotal: 34359738367 kB
VmallocUsed:    275624 kB
VmallocChunk: 34359462559 kB
HugePages_Total:     0
HugePages_Free:      0
HugePages_Rsvd:      0
Hugepagesize:     2048 kB
unlimit-a命令:

core file size          (blocks, -c) 0
data seg size           (kbytes, -d) unlimited
scheduling priority             (-e) 0
file size               (blocks, -f) unlimited
pending signals                 (-i) 3153920
max locked memory       (kbytes, -l) 32
max memory size         (kbytes, -m) unlimited
open files                      (-n) 1024
pipe size            (512 bytes, -p) 8
POSIX message queues     (bytes, -q) 819200
real-time priority              (-r) 0
stack size              (kbytes, -s) 10240
cpu time               (seconds, -t) unlimited
max user processes              (-u) 3153920
virtual memory          (kbytes, -v) unlimited
file locks                      (-x) unlimited

我是用pgf90编译的。但如果我是由gfortran编译的,就没有问题了

您的问题很可能是内存问题

您的数组需要每个nspec的
459*299*27*24*4B
(假设默认
real
需要
4B
内存)。对于
nspec==24
,这导致大约
7.95GiB
的内存需求,而
nspec==25
需要大约
8.28GiB


我猜,您的物理内存被限制为8GiB,或者一些
ulimit
限制了此过程允许的内存量。

不一定是内存不足。阵列的大小为
223 304 200
。这可能接近最大32位整数
2147 483 648

看起来编译器在内部使用的元素计数溢出。对
malloc
的内部调用请求的内存不足,因此任何读取最后部分元素的尝试都会失败

这是编译器在其默认设置中的一个限制。通过使用选项
-Mlarge\u arrays
,可以将其设置为使用64位寻址


请参见此处的

在Mac上使用gfortran 5.2可以很好地工作。使用‑Mlarge_arrays pgf90编译器标志可以解决此问题。这一段是关于静态数组的。答案可能在编译器开关中,但在mcmodel中。最后,实际上是-Mlarge_arays。但是,从该页面上看,不清楚哪个页面处理了不同的问题(在数据段中拟合静态数据)。我上面提到的手册更清楚地描述了它的功能。