Image processing 在倍频程中读取tif文件时出现问题

我正在尝试使用倍频程读取

.tif

格式的医疗成像数据。碰巧只有来自的软件才有能力读取我的医学图像。我所指的图像样本就是其中之一。此图像只能在斐济以

.tif

格式读取。图像也可以转换为jpg图像。仅在数据点对其他图像编辑软件可见之后。现在的问题是，我想把它加载到八度音阶中去读它——目前这是不可能的。倍频程中的

imshow（）

函数不允许我可视化给定的

.tif

文件

---

所以，如果有人有阅读这种文件格式的经验，请让我知道。谢谢。

您的链接图像是16位灰度图像，请参阅

$gm identify-verbose hello.tif

。因此，让我们将其加载到GNU倍频程：

img = imread ("hello.tif");
hist (img(:), 200);            # show histogram

啊!！，图像的主要信息在0-600范围内（可能使用的图像采集系统的分辨率为11或12位），因此让我们将此部分缩放并打印为彩色编码（viridis）图像：

这是你想要的吗？当然，我们也可以使用灰色颜色贴图，请尝试：

colormapglay

---

如果这仍然不符合您的需要，您应该真正解释您希望看到的内容。…

您的链接图像是16位灰度图像，请参阅

$gm identify-verbose hello.tif

。因此，让我们将其加载到GNU倍频程：

img = imread ("hello.tif");
hist (img(:), 200);            # show histogram

啊!！，图像的主要信息在0-600范围内（可能使用的图像采集系统的分辨率为11或12位），因此让我们将此部分缩放并打印为彩色编码（viridis）图像：

这是你想要的吗？当然，我们也可以使用灰色颜色贴图，请尝试：

colormapglay

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如果这仍然不符合您的需要，您应该真正解释您希望看到的内容……

您可能需要解释斐济（ImageJ）默认工作的原因。原因是，对于非8位图像，ImageJ仅使用图像的最大值和最小值。可以设置其他值，但即使如此，也只能在最大值和最小值之间设置。从不使用数据类型的实际限制。这是有道理的，因为大多数16位图像从一开始就不是来自16位相机。我对使用过滤器去除图像的噪声感兴趣。目前我不能使用八度音阶的'imshow（）'。我发现的一个原因是，据说图像编码为16位，但倍频程只允许显示8位的图像。那么，有没有成功的方法来使用

imshow（）

@motiur：正如我上面所说的“倍频程只允许显示8比特的图像”是不对的。拍摄上述图像的相机分辨率为11或12位，存储为16位整数。因此，通常将其缩放到0..1范围内以进行进一步处理。如果您只使用

imshow

而没有限制，它会将值0显示为黑色，将值2^16-1显示为白色，但由于您的整数范围为0..2000（请参见我的直方图），因此您会看到一个几乎为黑色的图像。这里没有魔法你可能想解释为什么斐济（ImageJ）默认工作。原因是，对于非8位图像，ImageJ仅使用图像的最大值和最小值。可以设置其他值，但即使如此，也只能在最大值和最小值之间设置。从不使用数据类型的实际限制。这是有道理的，因为大多数16位图像从一开始就不是来自16位相机。我对使用过滤器去除图像的噪声感兴趣。目前我不能使用八度音阶的'imshow（）'。我发现的一个原因是，据说图像编码为16位，但倍频程只允许显示8位的图像。那么，有没有成功的方法来使用

imshow（）

@motiur：正如我上面所说的“倍频程只允许显示8比特的图像”是不对的。拍摄上述图像的相机分辨率为11或12位，存储为16位整数。因此，通常将其缩放到0..1范围内以进行进一步处理。如果您只使用

imshow

而没有限制，它会将值0显示为黑色，将值2^16-1显示为白色，但由于您的整数范围为0..2000（请参见我的直方图），因此您会看到一个几乎为黑色的图像。这里没有魔法