Java 读取文件并标识括号之间的字符串

我试图命名将出现在最后一组括号“genesym”之间的字符串。到目前为止，我正在用制表符替换每个括号的最后一个匹配项。在这些函数之间，我想将现有字符串命名为genesym

我意识到这是一个扫描器功能，但这是我知道怎么说的唯一方法

import java.lang.*;
import java.io.*;

public class TESTING
{
    public static void main(String[] args)
    {
        try {
            BufferedReader br = new BufferedReader(new FileReader("human.rna.fna"));
            BufferedWriter bw = new BufferedWriter(new FileWriter("FormattedHumanRNA"));

            String line
            String genesym;

            while ((line = br.readLine()) != null) {
                if (line.startsWith(">")) {
                    // Replaces the last set of parenthesis with a tab character
                    int openbracket =  line.lastIndexOf("(");
                    line = new StringBuilder(line)
                        .replace(openbracket, openbracket + 1, "\t")
                        .toString();


                    **genesym = br.nextString();**


                    // Replaces the last close parenthesis with a tab character
                    int closebracket = line.lastIndexOf(")");
                    line = new StringBuilder(line)
                        .replace(closebracket, closebracket + 1, "\t")
                        .toString();
                } else {
                    line = line.replaceAll ("\n", "");
                }

                bw.write(genesym + " : " + line);
            }
            br.close();
            bw.close();
        } catch(IOException e) {
            e.printStackTrace(System.err);
        }
    }
}

示例：（我的数据比这个大得多，大约100万行）

输入文件：

>365 (LOC1), long non-coding RNA AGCGTCT

>22 (1*split3**) (FLJ), long RNA AAAATC

>13 (RTV), RNA ATGCG

期望输出：

LOC1 : >365      LOC1     , long non-coding RNA AGCGTCT

FLJ : >22 (1*split3**)      FLJ     , long RNA  AAAATC

RTV : >13     RTV     ,RNA ATGCG

---

然后替换你想替换的。

你的问题不清楚。可以包括正在读取的输入文件以及希望输出的内容吗？字符串genesym=line.substring（lastIndexOf（“”），lastIndexOf（“”）；为什么我不能这样做？字符串genesym=line.substring（line.lastIndexOf（“（”），line.lastIndexOf（“）”）；伟大的谢谢你的帮助。我很感激。

String genesym=line.substring(openbracket,closebracket);