为什么Julia 0.3.12（MixedModels 0.3.22）和Julia1.2（MixedModels 2.2.0）之间的混合模型拟合时间存在巨大差异？

我正在运行一个线性混合效应模型，数据集由约500K个观测值组成。 我有一个连续的回答（即Y），24个分类变量（即X1，…，X24）， 8个连续变量（即Z1，…，Z8）和一个ID变量（即1160级的ID），用于指定随机效应。 线性混合模型公式为Y~X1+…+X24+Z1+…+Z8+（0+X1|ID）+…+（0+X24 | ID）

在Windows中，为了适应Julia 0.3中的模型，我使用MixedModels包（版本0.3.22），使用以下内容：

预拟合步骤：

fit1=lmm（my_公式，my_数据）

，以及

安装步骤：

安装（fit1）

预安装步骤约需38秒，安装步骤约需14秒；总共52秒

同样，在Windows中，该模型使用MixedModels（版本2.2.0）安装在Julia 1.2中：

预拟合步骤：

fit2=LinearMixedModel（@formula（my_公式）、my_数据）

，以及

安装步骤：

安装！（fit2）

在这种情况下，预安装步骤需要约20秒，而安装步骤需要约301秒（总共321秒）

在同一服务器中设置Linux Docker并将Julia 1.2与MixedModels（版本2.2.0）一起使用时：

预拟合步骤：

fit3=LinearMixedModel（@formula（my_公式）、my_数据）

，以及

安装步骤：

安装！（fit3）

预安装步骤约需21秒，而安装步骤约需108秒（总共129秒）。 在这种情况下，如果考虑将线程数设置为1，预拟合步骤需要25秒，而拟合步骤为55秒（总计80秒）。 总结结果见下文。请注意，已调查了更多配置。 关于列，该模型适用于Windows或DockedLinux（列Windows/Linux）。 我已经检查过将线程数设置为1，或者允许它在模型拟合之前获取其默认值（列：BLAS.set_num_threads（1））

假设我多次运行这些模型，那么Julia 0.3.12与其他方法之间的差异将持续数小时。 即使在Linux中使用Julia 1.2运行该模型并将线程数设置为1，该过程所需的时间也会增加50%。 有人知道这种差异来自哪里吗？有没有办法加快Julia 1.2中的拟合过程，或者使其在某种程度上与Julia 0.3.12相当

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这是一台Windows 2012服务器，CPU为Intel Xeon@3.5GHz E5-2637 v3（4核；8线程）和64 GB RAM。Windows和Linux都是在同一台服务器上运行的。

Julia 0.3基本上是石器时代的产品。该软件包的维护人员几天前发布了3.0.0版本。也许他们解决了一些性能问题。在任何情况下，在不同的软件包版本之间，速度都明显下降了（这和julia版本本身几乎没有关系），所以打开这个问题是有意义的。

+---------------+---------------+-------------------------+--------------+----------+------------+
| Windows/Linux | Julia version | BLAS.set_num_threads(1) | Pre-fit time | Fit time | Total time |
|               | (MixedModels) |                         |              |          |            |
+---------------+---------------+-------------------------+--------------+----------+------------+
|               | 0.3.12(0.3.22)| No                      |       38 sec |   14 sec |     52 sec |
|               +---------------+-------------------------+--------------+----------+------------+
| Windows       | 1.2 (2.2.0)   | No                      |       20 sec |  301 sec |    321 sec |
+---------------+---------------+-------------------------+--------------+----------+------------+
|               | 1.2 (2.2.0)   | No                      |       21 sec |  108 sec |    129 sec |
|               +---------------+-------------------------+--------------+----------+------------+
|               | 1.2 (2.2.0)   | Yes                     |       25 sec |   55 sec |     80 sec |
| Linux Docker  +---------------+-------------------------+--------------+----------+------------+
|               | 1.4 (2.2.0)   | No                      |       25 sec |  108 sec |    133 sec |
|               +---------------+-------------------------+--------------+----------+------------+
|               | 1.4 (2.2.0)   | Yes                     |       24 sec |   57 sec |     81 sec |
+---------------+---------------+-------------------------+--------------+----------+------------+