Linux TCSH foreach语法错误：“引用”；（“意外

所以我有基本的脚本：

foreach x (*.nii)

        mri_convert -i $x -o $x:r.mgz -it nii -ot mgz
end

本质上，它应该将所有.nii文件的文件类型更改为.mgz。当我在tcsh中运行此操作时，我收到：

./test1: 1: ./test1: Syntax error: "(" unexpected

我真的不确定为什么会出现这个错误，因为foreach的正确语法通常是：

foreach x (1 2 3)

     echo $x
end

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我弄错了吗？

如果您的计算机上安装了tcsh或csh shell，那么至少应该运行以下脚本而不出错

#!/bin/tcsh

foreach x (*.nii)
  mri_convert -i $x -o $x:r.mgz -it nii -ot mgz
end

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听起来您运行脚本时使用的是

sh

而不是tcsh。请确保脚本的第一行是

#！/usr/bin/env tcsh

。使用tcsh发出run命令是不够的。有些shell需要空格字符来分隔语法元素。（我现在记不起来[t]csh是否需要这样做）。可能是

foreach x（*.nil）

会有帮助。但请同意，您需要像

#！/bin/tcsh这样的内容作为第一行。祝您好运。这是我的问题，谢谢！