Linux 将环境变量传递给qsub作业

我想向qsub命令的PATH环境变量添加一个字符串。编辑.sh文件不是一个选项，因为它是在管道中生成和运行的（我可以编辑qsub命令选项）

我正在运行以下qsub命令：

qsub-pe插槽16-S/bin/bash-cwd-N“管道”-j y-o /home/user/log/out.log/home/user/pipeline/runthis.sh

我需要将以下PATH环境变量添加到正在运行的shell中：

/主页/用户/jre1.8.0_66/bin

（这是因为脚本依赖于比集群上更新的java版本）

我尝试了以下方法：

qsub-pe插槽16-S/bin/bash-cwd-N“管道”-j y-o /home/user/log/out.log/home/user/pipeline/runthis.sh-v PATH=/home/pa354/jre1.8.0_66/bin:$PATH-V

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这不起作用，我将“env”添加到正在运行的bash文件中（以检查环境变量），我所需的路径尚未添加。

您需要在

qsub

命令中使用

-v

：

qsub -v JAVA_HOME ...

这将把环境变量从调用环境传递到生成的作业中

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请注意，

qsub

的

-v

参数必须位于远程节点上运行的实际命令的参数之前。您似乎在整个命令行的末尾尝试了它，但它不起作用。

您需要在

qsub

命令中使用

-v

：

qsub -v JAVA_HOME ...

这将把环境变量从调用环境传递到生成的作业中

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请注意，

qsub

的

-v

参数必须位于远程节点上运行的实际命令的参数之前。您似乎在整个命令行的末尾尝试了它，但它不起作用。

是的，但是我如何向PATH变量添加字符串呢。我已经尝试了以下qsub-V，qsub-V PATH=/…/../bin$PATH，qsub-V PATH=/../bin$PATH-V。我正在运行一个bash脚本，“env”输出没有显示对PATH变量的任何添加。@ParsaAkbari:请看我的更新，您需要对命令行的元素重新排序一点。是的，但是我如何向PATH变量添加字符串呢。我已经尝试了以下qsub-V，qsub-V PATH=/…/../bin$PATH，qsub-V PATH=/../bin$PATH-V。我正在运行一个bash脚本，“env”输出不会显示对PATH变量的任何添加。@ParsaAkbari：请参阅我的更新，您需要稍微重新排序命令行的元素。