linux shell远程站点中的信号11。如何排除故障

linux shell远程站点中的信号11。如何排除故障,linux,supercomputers,Linux,Supercomputers,我是一名生物专业的学生,最近才开始做研究工作的主要编码工作。为了支持研究,我们的校园内有一台超级计算机供研究人员使用。我从这台超级计算机远程工作,它使用linux外壳访问它并提交作业。我正在使用安装在计算机上的一个名为Mauve的程序编写一份工作提交脚本,用于对齐许多基因组。现在我已经在Mauve fine上运行了一个作业,并修改了该作业的脚本以适应此作业。只是这一次我一直犯这个错误 Storing raw sequence at /scratch/addiseg/Elizabethkingia

我是一名生物专业的学生,最近才开始做研究工作的主要编码工作。为了支持研究,我们的校园内有一台超级计算机供研究人员使用。我从这台超级计算机远程工作,它使用linux外壳访问它并提交作业。我正在使用安装在计算机上的一个名为Mauve的程序编写一份工作提交脚本,用于对齐许多基因组。现在我已经在Mauve fine上运行了一个作业,并修改了该作业的脚本以适应此作业。只是这一次我一直犯这个错误

Storing raw sequence at
/scratch/addiseg/Elizabethkingia_clonalframe/rawseq16360.000
Sequence loaded successfully.
GCA_000689515.1_E27107v1_PRJEB5243_genomic.fna 4032057 base pairs.
Storing raw sequence at 
/scratch/addiseg/Elizabethkingia_clonalframe/rawseq16360.001
Sequence loaded successfully.
e.anophelisGCA_000496055.1_NUH11_genomic.fna 4091484 base pairs.
Caught signal 11
Cleaning up and exiting!
Temporary files deleted.
所以我不知道如何解决这个问题。我很抱歉,如果这是超级基本和浪费时间,但我不知道如何在远程站点解决这个问题。到目前为止,我所看到的所有可能的解决方案都要求我访问我无法控制的硬件或软件。 我当前的提交脚本如下

module load mauve 
progressiveMauve --output=8elizabethkingia-alignment.etc.xmfa --output-guide-tree=8.elizabethkingia-alignment.etc.tree --backbone-output=8.elizabethkingia-alignment.etc.backbone --island-gap-size=100 e.anophelisGCA_000331815.1_ASM33181v1_genomicR26.fna GCA_000689515.1_E27107v1_PRJEB5243_genomic.fna e.anophelisGCA_000496055.1_NUH11_genomic.fna GCA_001596175.1_ASM159617v1_genomicsrr3240400.fna e.meningoseptica502GCA_000447375.1_C874_spades_genomic.fna e.meningoGCA_000367325.1_ASM36732v1_genomicatcc13253.fna e.anophelisGCA_001050935.1_ASM105093v1_genomicPW2809.fna e.anophelisGCA_000495935.1_NUHP1_genomic.fna

如果远程代码没有使用调试符号编译,或者您没有在调试器中运行它的权限,那么您需要从其他人那里获得帮助……如果ulimit settings&c允许,您还可以查看如何配置系统以存储核心转储。允许并分析该内核转储,但如果没有调试构建,它仍然不是很有用。简短形式:与编写和维护软件的人员交谈……我还删除了bash标记:仅仅因为您从shell启动程序并不意味着这是一个与shell相关的问题,除非该程序实际上是作为shell脚本编写的。该程序可能会在没有注意到的情况下耗尽内存。您可以尝试的唯一解决方法是:为每个序列启动程序,但要单独启动。您可能需要创建一个脚本来完成此任务。(看起来程序对每个序列执行一个简单的{input,process,output}循环)