Linux 如何将列从一个文件粘贴到另一个临时文件？

我已经编辑了前面的问题，因为它太长太烦人了，现在我已经找到了我想要的东西，我看到下面代码中的一些操作中有一个小故障。寻求建议

我有代码，现在它可以正常工作，但我得到了一个额外的0行，我无法理解为什么？有什么建议吗

代码

输出

chr start   end test_K27ac_S12818   test_K27ac_S12838   test_K27me3_S12815_5cols    test_K27me3_S12830_5cols    test_K4me1_S12816   test_K4me1_S12831   test_K4me1_S12836
chr1    754118  754696  0   0   0   0   290 576 0
chr1    804929  805633  0   0   704 0   277 0   704
chr1    826069  826438  0   0   0   0   369 0   0
chr1    839340  839608  0   0   268 0   268 0   0
chr1    840388  843628  0   0   3240    0   816 2434    923
chr1    845517  847768  0   0   2251    820 1113    2106    1677
chr1    850950  854146  0   0   3196    3196    2184    3196    1302
chr1    855361  857280  0   0   1919    0   1911    1919    979
chr1    857930  859278  0   0   1348    0   1139    1125    923
chr1    859906  860677  351 0   771 463 0   0   771
    0

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一切都很好，除了最后一行显示为0，不知道为什么？？任何建议

我相信我做的是正确的，所以我自己修改了代码，我就是这样做的

#!/bin/bash
#$ -S /bin/bash

cd /path/vdas/client/ChIP-Seq/output/merge_MACS2_peaks_patient_specific/EOC/test

cut -f 1,2,3 /path/vdas/client/ChIP-Seq/output/merge_MACS2_peaks_patient_specific/EOC/test_merge.bed > tmp
printf "chr\tstart\tend" > tsamples
for file in `ls *.bed`; do
    printf "\t" >> tsamples
    printf `basename $file .bed` >> tsamples
    #echo $file | cut -d_ -f 1,2,3 >> tsamples
    intersectBed -wao -a /path/vdas/client/ChIP-Seq/output/merge_MACS2_peaks_patient_specific/EOC/test_merge.bed -b $file -f 0.20 | cut -f 9 | tail -n+1 | paste tmp - > tmp2
    mv tmp2 tmp
done
echo "" >> tsamples
cat tsamples tmp > histone_marks.map
rm tsamples tmp
sed '$d' histone_marks.map

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这确实有效，但我知道这是一种非常粗糙的方法。我不明白为什么最后一行0会出现，但我相信它是用bash进行的某种操作，但不适用于intesectBed操作，因为列非常好。

您的问题在于intersectBed之前的printf语句：删除printf语句中数字3后的逗号是的，我找到了，谢谢，但问题是输出没有标题，而且我希望输出有文件名的典型标题和输出文件的前3个字段合并，如我的输出mentioend如果您自己回答了这个问题，请考虑把答案张贴并接受，其实答案并不完全正确。我需要一些建议。我想出了一种方法来进行更改，但是我得到了一些额外的行，我不应该这样做。我怎样才能把我制作的全部代码和我得到的期望输出放在一起呢。Thanks@pcantalupo我编辑了我的查询，你能告诉我为什么最后一行是0吗？

#!/bin/bash
#$ -S /bin/bash

cd /path/vdas/client/ChIP-Seq/output/merge_MACS2_peaks_patient_specific/EOC/test

cut -f 1,2,3 /path/vdas/client/ChIP-Seq/output/merge_MACS2_peaks_patient_specific/EOC/test_merge.bed > tmp
printf "chr\tstart\tend" > tsamples
for file in `ls *.bed`; do
    printf "\t" >> tsamples
    printf `basename $file .bed` >> tsamples
    #echo $file | cut -d_ -f 1,2,3 >> tsamples
    intersectBed -wao -a /path/vdas/client/ChIP-Seq/output/merge_MACS2_peaks_patient_specific/EOC/test_merge.bed -b $file -f 0.20 | cut -f 9 | tail -n+1 | paste tmp - > tmp2
    mv tmp2 tmp
done
echo "" >> tsamples
cat tsamples tmp > histone_marks.map
rm tsamples tmp
sed '$d' histone_marks.map