List 在numpy中迭代列时缺少行

List 在numpy中迭代列时缺少行,list,List,我正在尝试传递一个包含x,y,z坐标的csvfie。我正在使用Python的NumPy包来实现这一点,如下面的代码所示: enter code here# !/usr/bin/python from __future__ import print_function import numpy as np import pandas as pd pdb_file=open('/home/josh/Documents/cordinates_all.csv') x_new_file=open('/h

我正在尝试传递一个包含
x
y
z
坐标的
csv
fie。我正在使用Python的
NumPy
包来实现这一点,如下面的代码所示:

enter code here#
!/usr/bin/python

from __future__ import print_function
import numpy as np
import pandas as pd

pdb_file=open('/home/josh/Documents/cordinates_all.csv')
x_new_file=open('/home/josh/Documents/x_new_cordinates.txt','w+')
y_new_file=open('/home/josh/Documents/y_new_cordinates.txt','w+')
z_new_file=open('/home/josh/Documents/z_new_cordinates.txt','w+')
test=open('/home/josh/Documents/test.txt','w+')

cordinates=np.genfromtxt(pdb_file,delimiter=",")



###slicing each "column" on the basis of X ,Y and Z cordinates
x=cordinates[:,][:,0]  
y=cordinates[:,][:,1]
z=cordinates[:,][:,2]


x_max=max(x)
x_min=min(x)

cx=(x_max-x_min)/2.0

y_max=max(y)
y_min=min(y)

cy=(y_max-y_min)/2.0

z_max=max(z)
z_min=min(z)

cz=(z_max-z_min)/2.0

###list of centre cordinates
cxyz=[cx,cy,cz]


####print(len(x),len(y),len(z))
#####print(np.isnan().any()) #check for missing values in the array
for count,elem in enumerate(y):
  print(count ,file=test) 
  print (((x[count])*1.05),file=x_new_file)
print(count,file=test)
行只是检查我是否在count变量中得到了83366的值(我得到了)

坐标文件有83367行。使用
len()
我可以验证所有
x
y
z
列的行数是否相同。此外,使用
isnan().any()
我可以验证它们没有任何
NaN
或缺少值

然而,当我在每一列上循环对每一个值执行算术运算时,每一列都会得到不同数量的元素,我不知道为什么

我刚接触过
NumPy
软件包,所以可能是我做错了什么

请告知

注意:我在
Ubuntu
15.04的enthund
canopy
环境下使用Python 2.7。

在文件对象上使用flush()解决了这个问题