Matlab 移除循环:从包含所有实例之间距离的矩阵中提取相邻距离
我试图在我的N个数据点和它们的K个邻居之间创建一个距离矩阵。数据矩阵是Matlab 移除循环:从包含所有实例之间距离的矩阵中提取相邻距离,matlab,nearest-neighbor,Matlab,Nearest Neighbor,我试图在我的N个数据点和它们的K个邻居之间创建一个距离矩阵。数据矩阵是NxA,因此距离矩阵Y\u距离是NxN,每个i,jth条目是数据点i和j之间的距离。使用knnsearch我得到了每个数据点的行号矩阵及其K邻域,称为IDX,然后我执行降维,并希望使用低维空间中相邻点之间的距离。我目前正在使用for循环: no_neighbours=k; IDX = knnsearch(X,X,'K',no_neighbours); Y_Distances = sqrt(dist2(y, y)); f
NxA
,因此距离矩阵Y\u距离
是NxN
,每个i,jth
条目是数据点i
和j
之间的距离。使用knnsearch
我得到了每个数据点的行号矩阵及其K
邻域,称为IDX
,然后我执行降维,并希望使用低维空间中相邻点之间的距离。我目前正在使用for循环:
no_neighbours=k;
IDX = knnsearch(X,X,'K',no_neighbours);
Y_Distances = sqrt(dist2(y, y));
for i = 1:N
for j= 1:A
Y_neighbour_distances = Y_Distances(i,IDX(i,j));
end
end
关于如何避免这些循环的任何建议,因为它们在大型数据集上非常耗时。您可能需要调用sparse:
I = ndgrid(1:N, 1:K);
sparse(I, IDX, Y_Distances)
向我们展示涉及
knnsearch
的代码,以及该代码如何插入到列出的代码中?