Module Biopython，PYTHONPATH，查找模块时遇到的问题

我安装了Biopython，但我无法让计算机识别模块。例如，我在Komodo中创建了一个文本文件，如下所示：

from Bio.Alphabet import IUPAC
from Bio import Seq
my_prot=Seq.Seq("AGTACACTGGT",IUPAC.protein)

并在终端运行，接收：

Traceback (most recent call last):
  File "bio.py", line 1, in <module>
    from Bio.Alphabet import IUPAC
ImportError: No module named Bio.Alphabet

回溯（最近一次呼叫最后一次）：
文件“bio.py”，第1行，在
从Bio.Alphabet导入IUPAC
ImportError:没有名为Bio.Alphabet的模块

---

作为记录，我也不能让模块以交互模式导入。文档说明，我可以通过导出到名为PYTHONPATH的环境变量（与path类似）来附加模块搜索路径，但是当我在终端中键入“env”时，我看不到这种类型的环境变量。我是生物学家，不是计算机科学家或程序员。如果这听起来像胡说八道，请容忍我的天真。

您必须找到您需要的模块（Bio）所在的目录，然后将目录路径添加到

PYTHONPATH

$ export PYTHONPATH=/usr/local/bio-python/

您必须指定找到的路径，而不是

/usr/local/bio-python/

要查找模块，您必须使用以下内容：

$ find / -name \*Bio\*

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这只是一个例子。当然，如果您能提供一些附加信息（例如，您在何处安装了模块等）会更好。

按开始按钮，右键单击我的计算机，选择属性，转到高级，单击环境变量。然后找到path变量，并通过添加分号对其进行编辑，然后添加path。例如，如果我的path变量现在是“C:\Program Files\Java\jdk1.7.0\u 02\bin”，我可以将其更改为“C:\Program Files\Java\jdk1.7.0\u 02\bin；（将path放在这里）”

啊，好的。看起来我已经通过设置PYTHONPATH和设置路径一样的方式实现了。现在我的问题是：如何使它不必在每次启动bash时重新分配PYTHONPATH变量？有几个选项。第一个：您可以将

导出PYTHONPATH=/usr/local/bio-python/

添加到

~/.bash\u profile

。第二个：您可以修改脚本，使其自动将目录添加到自己的路径（

sys.PATH

）。还有其他方法。再次感谢你，伊戈尔。我修改了我的.bash_配置文件以包括导出我的PYTHONPATH。云已经散开了。@user1480431:你是如何安装biopython的？通常，如果您已经正确安装了python模块，则不需要使用PYTHONPATH来导入它，因为安装位置应该已经在路径中。谢谢。我在OSX中运行终端，但如果我发现自己需要在Windows PC上更改路径设置，我会记住这一点。