Mpi 带SLURM的非对称混合映射

我想用

slurm

做一个非对称混合映射

我的代码需要有3个mpi任务。但是，只有

任务1

和

2

需要多个cpu。

mpi任务0

只需要一个cpu

我目前使用此

slurm

配置：

#SBATCH --nodes 3
#SBATCH --ntasks 3
#SBATCH --cpus-per-task 32

在这个配置中，我为每个

mpi任务

分配了32个cpu。但是节点0中的31个CPU未被使用，因为

mpi任务0

仅使用一个

您知道如何配置

slurm

作业来执行非对称分配吗

一个cpu用于mpi任务0，31个cpu用于mpi任务1，31个cpu用于mpi任务2。通过这种方式，我可以最大限度地利用2个节点，而不必为一个cpu使用第3个节点

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我在

slurm

文档中找不到

引入了17.11版本，因此您可以指定如下内容：

#SBATCH --nodes 1 --ntasks 1 --cpus-per-task 1
#SBATCH packjob
#SBATCH --nodes 2 --ntasks 2 --cpus-per-task 32

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一个MPI列组有一个CPU，两个列组有32个CPU。

不幸的是，slurm的版本低于17.11。。但是，我通过使用cpu掩码选项来优化一个节点上的运行：“SBATCH--nodes 1`` SBATCH--exclusive`

srun--ntasks=3--cpu_bind=mask_cpu:0x1,0xFFFE，0b1FFFC000./mybinary

当我想对两个节点使用相同的解决方案时，我得到了最差的计算时间！它可能来自CPU的随机选择。。。您知道为一个任务选择同一节点上的CPU的解决方案吗？非常感谢damienfrancois