Parallel processing 使用gnu并行在wine下运行windows程序

我有一个非常基本的脚本，可以在Wine下运行windows群体遗传学程序（msvar.exe）的多个副本。它使用“查找”在多个文件夹中查找启动文件（INTFILE），然后使用该启动文件在每个目录中启动msvar.exe实例。不同的文件夹在初始化文件中将有不同的参数，因此我可以通过添加“&”参数来运行一系列模拟。在这里

for i in $(find /home/msvartest -name INTFILE -type f)
do (
cd $(dirname $(realpath $i));
#   wine explorer /desktop=name msvar.exe;
wineconsole --backend=user msvar.exe;
) &
done

目前，在我的双六核机器上，我在自己的wineconsole（或wine explorer窗口）下一次运行多达20个msvar.exe副本。每个运行实例可能需要3到4天的时间，但是程序只在一个内核上运行，所以我需要并行运行模拟。看起来Gnu parallel将是运行msvar.exe的更好方式，并允许我在远程计算机上运行更多模拟。按照中的建议，我尝试让Gnu与wineconsole并行工作，但没有成功。有没有人能帮我，或者更好的是编一个我可以用的剧本

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谢谢您的帮助。

我认为您的命令将变得非常冗长和笨拙，除非您使用这样的导出函数：

#!/bin/bash

doit() {
   ...
   ...
}

export -f doit
parallel -j 10 doit ::: {0..99}

因此，对于您的示例，它看起来类似于（未经测试）：

不幸的是，我没有设置您的环境来测试这一点，但是如果有小错误，它应该很接近并且很容易纠正。试着看看它能做什么，然后删除

--dry run

，让它真正做点什么

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如果您的文件名中有空格，您应该在

find

命令中使用

-print0

，并在

parallel

之后添加

-0

，但这只是暂时使事情复杂化。

{%}在函数中没有被替换，只是在命令行中。太棒了，这让我找到了正确的方向，我甚至大致了解了它们的工作原理（我是一名生物学家，对编程的了解只够危险！！）。现在，我们来看一下在远程服务器上使用parallel运行msvar.exe的问题。如果我只是在“parallel”和“doit”（在帮助文件后面）之间添加远程服务器的详细信息，那么远程服务器会说“doit”不是命令，原因很明显，即使对我来说也是如此。如何将其修改为复制数据文件夹，并允许其在安装了msvar.，exe的远程服务器上运行？YIKES！你也快到我能力的极限了！也许让它在一台服务器上运行，然后问一个新问题，关于如何在额外的远程服务器上并行传播数据和工作，希望Ole仍然像往常一样关注。是的。从发布在一台机器上运行的脚本开始，让我们从那里开始吧。抱歉，神奇意味着它运行了！！我所要做的就是将目录修改为正在使用的目录，删除--dry run，它马上就可以工作了。此工作doit（）{echo Processing$1#cd$（dirname$（realpath“$1”）；cd$（dirname$（readlink-f“$1”）；wineprifix=$HOME/slot{%}wine/HOME/DaveB/msvar/msvar0.4.1b/msvar.exe}export-f doit find/HOME/DaveB/msvar/msvar\ORC\u NEWUPLOAD-name INTFILE-type f | parallel doitYep，您是对的，一如既往。看起来好多了；-）很高兴你接受了我的答案，但事实上，@OleTange（他是杰出的GNU平行图的作者）的答案更正确——请看他在我答案下面的评论。不幸的是，我不够聪明，无法让Ole的脚本正常工作——太尴尬了！！

#!/bin/bash

doit() {
   echo Processing $1
   cd $(dirname $(realpath "$1"));
   WINEPREFIX=$HOME/slot$2 wineconsole --backend=user msvar.exe
}
export -f doit

find /home/msvartest -name INTFILE -type f | parallel doit {} {%}

#!/bin/bash

doit() {
   echo Processing $1
   cd $(dirname $(realpath "$1"));
   WINEPREFIX=$HOME/slot$2 wineconsole --backend=user msvar.exe
}
export -f doit

find /home/msvartest -name INTFILE -type f | parallel doit {} {%}