Python Networkx解析gml写入不可用的gml文件

我一直在尝试解析networkx gml的一些附加属性以供以后使用，但遇到了一个问题

当从Cytoscape获得一个gml文件时，networkx输出一个它自己无法读取的gml文件

即Cytoscape->进入networkx->输出->进入networkx->错误：

pyparsing.ParseException: Expected "]" (at char 1116756), (line:71732, col:3)

现在，该错误在节点之后请求一个额外的“]值（即使图形忽略边），如果您这样做，图形将正常工作。但是，它不再有任何边缘

为了全面测试这一点，我执行了“Cytoscape->Into networkx->Output”，根本不更改代码，只需：

DG = nx.read_gml("KeggComplete.gml", relabel = True)
nx.write_gml(DG, "KeggCompleteEng.gml")
exit()

然后用以下内容阅读：

BasicGraph = nx.read_gml("KeggCompleteEng.gml", relabel = True)

误差仍然是可重复的。所以我认为这与networkx编写gml文件的方式有关

我使用的两个文件是：

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如果有人能深入了解为什么会发生这种情况，我们将不胜感激

Pyparsing不是识别何时发生解析错误的最聪明的库。该库的较新版本确实支持一些更好的错误识别，但它们需要对解析器进行一些更新才能获得这些信息

在没有看到解析器的情况下，根据您的描述，解析器似乎希望看到以下内容：

[
  [
  bunch of nodes...
  ]
  [
  optional bunch of edges...
  ]
]

所发生的是，它成功地通过了“节点束…”，然后在“可选的边束…”部分的一条边中发现了一些语法问题。因为这是可选的，所以只要在节点之后有一个结束']'，事情仍然有效。这就是为什么会收到pyparsing异常消息。但真正的问题是其中一个边缘有一个打字错误

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要诊断此问题，请尝试仅为解析器提供前几条边。然后继续添加越来越多的边，直到出现pyparsing错误-最近添加的边包含关键语法错误。

这是NetworkX在生成嵌套属性（本例中为边图形数据）时出现的错误。 错误地将一组额外的引号添加到“Line”属性中

修复程序已作为此拉取请求的一部分合并：