Warning: file_get_contents(/data/phpspider/zhask/data//catemap/4/matlab/15.json): failed to open stream: No such file or directory in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 167

Warning: Invalid argument supplied for foreach() in /data/phpspider/zhask/libs/tag.function.php on line 1116

Notice: Undefined index: in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 180

Warning: array_chunk() expects parameter 1 to be array, null given in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 181
Python 3套以上的比例维恩图_Python_Matlab_Plot_Matplotlib - Fatal编程技术网

Python 3套以上的比例维恩图

Python 3套以上的比例维恩图,python,matlab,plot,matplotlib,Python,Matlab,Plot,Matplotlib,我在MongoDB中有一个文档集合,每个文档在列表中都有一个或多个类别。使用map reduce,我可以获得每个类别的唯一组合包含多少文档的详细信息: ['cat1'] = 523 ['cat2'] = 231 ['cat3'] = 102 ['cat4'] = 72 ['cat1','cat2'] = 710 ['cat1','cat3'] = 891 [

我在MongoDB中有一个文档集合,每个文档在列表中都有一个或多个类别。使用map reduce,我可以获得每个类别的唯一组合包含多少文档的详细信息:

['cat1']               = 523
['cat2']               = 231
['cat3']               = 102
['cat4']               = 72
['cat1','cat2']        = 710
['cat1','cat3']        = 891
['cat1','cat3','cat4'] = 621 ...
其中,总计是指能够精确组合类别的文档数

我正在寻找一种合理的方法来展示这些数据,我认为一个有比例面积的维恩图是个好主意。使用上述示例,cat1区域将为523+710+891+621,cat1和cat3之间的重叠区域将为891+621,cat1、cat3、cat4之间的重叠区域将为621等


有没有人对我如何实现这一点有什么建议?我最好用Python(+Numpy/MatPlotLib)或MatLab来做这件事。

一般来说,这是不可能的,除非大致上,交点图是a,并且没有四向交点。边缘长度也有限制(除非您愿意绘制无定形斑点来表示区域);因此,如果你坚持画圆圈,这甚至会受到限制

在非常简单的情况下,您可以制作一个例程来绘制一个三向维恩图,然后在三元组的“另一侧”上“添加”另一个圆。在上述情况下,
1,3,4
是该三元组,
2
是奇数

如果可能是因为数据满足上述条件(由于某些原因,图形是平面的,非常复杂),并且您使用的是无定形斑点,那么您可以绘制平面图形,并缓慢地将每条边“气球状”增长为椭球体。你可以用一种放松的方式来做这件事:如果它们的交点低于它们应该的值,它们就会膨胀;如果它们的交点高于它们应该的值,它们就会收缩。(他们实际上有两个维度来做这件事:育肥和拉长;根据需要选择。拉长将推动图表的其余部分,因此您必须检查这不会使事情变得不可能,例如使用基于弹簧的物理布局。)最终您可能会找到一个答案,您必须检查其准确性。

请参阅

不过,我不知道你会如何按比例缩放面积


也许如果你拿一张顺序合适的图表,把它镶嵌起来。然后你可以为每个三角形指定所需的区域,并进行某种压力扩散,允许顶点移动,可能允许一些压力“泄漏”从每个三角形到属于同一集合的相邻三角形?

您可能想尝试一下,但我也在MatPlotLib上找到了它,但我认为它没有被正式接受。

我认为ninjagecko是正确的,并且通常不能表示为交点图,除非您不介意该图是n维的。但是,如果每个类别都有一个显示其所有交点的图表,那么它可以用2D表示,而这个图表本身可以是一个单独的图表。因此,这可能是表示数据的更合适的方法。我制作了一个堆叠条形图来说明:

守则:

cats = ['cat1','cat2','cat3','cat4']
data = {('cat1',): 523, ('cat2',): 231, ('cat3',): 102, ('cat4',): 72, ('cat1','cat2'): 710,('cat1','cat3'): 891,('cat1','cat3','cat4') : 621}

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
from random import random

colors = dict([(k,(random(),random(),random())) for k in data.keys()])
print colors
for i, cat in enumerate(sorted(cats)):
    y = 0
    for key, val in data.items():
        if cat in key:
            plt.bar(i, val, bottom=y, color=colors[key])
            plt.text(i,y,' '.join(key))
            y += val
plt.xticks(np.arange(len(cats))+0.4, cats )
plt.show()
问题 我们需要表示多个相互关联的对象类别的计数,而维恩图只能表示少量的类别及其重叠

解决办法 将每个类别及其组合视为图中的一个节点。绘制图形,使节点的大小表示每个类别中的计数,边连接相关类别。这种方法的优点是:可以轻松容纳多个类别,这将成为一种连接气泡图

结果

代码 建议的解决方案使用创建数据结构并绘制它。如果数据以正确的格式显示,这将扩展到具有多个连接的大量类别

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt

def load_nodes():
    text = '''  Node    Size
                1        523
                2        231
                3        102
                4         72
                1+2      710
                1+3      891
                1+3+4    621'''
    # load nodes into list, discard header
    # this may be replaced by some appropriate output 
    # from your program
    data = text.split('\n')[1:]
    data = [ d.split() for d in data ]
    data = [ tuple([ d[0], 
                    dict( size=int(d[1]) ) 
                    ]) for d in data]
    return data

def load_edges():
    text = '''  From   To
                1+2    1
                1+2    2
                1+3    1
                1+3    3
                1+3+4    1
                1+3+4    3
                1+3+4    4'''
    # load edges into list, discard header
    # this may be replaced by some appropriate output 
    # from your program
    data = text.split('\n')[1:]
    data = [ tuple( d.split() ) for d in data ]
    return data

if __name__ == '__main__':
    scale_factor = 5
    G = nx.Graph()
    nodes = load_nodes()
    node_sizes = [ n[1]['size']*scale_factor
                  for n in nodes ]

    edges = load_edges()
    G.add_edges_from( edges )

    nx.draw_networkx(G, 
                     pos=nx.spring_layout(G),
                     node_size = node_sizes)
    plt.axis('off')
    plt.show()
其他解决方案
其他解决方案可能包括:、等。所有链接的示例都没有使用Python;它们只是为了说明的目的而给出的。

对Gauden的答案进行修改怎么样?每个类别都是一个节点,节点之间的加权边表示重叠程度。重叠越多,边缘越厚。

鉴于维恩图无法做到这一点(见下面ninjagecko的评论),而且由于有人提出了替代方案(见fraxel创意),我想我自己也会尝试一种替代方案,一种网络图。感谢大家提出的所有伟大创意和替代方案。我认为gauden的这个网络图想法最适合我的需要。