Python 将文件头行快速插入列中

我有一个fasta文件，其中包含序列头及其相应的序列，如下所示：

>ID101_hg19
ATGGGTGTATCGTACCC
>ID102_hg19
AGCTTTAGCGGGGTACA

我想将标题行更改为序列旁边另一个以制表符分隔的列。以下是所需的输出：

>ID101_hg19    ATGGGTGTATCGTACCC
>ID102_hg19    AGCTTTAGCGGGGTACA

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关于如何执行此任务，您有什么想法吗？

使用Sed，您可以像这样执行：

sed 'N;s/\n/\t/' file.txt

使用awk，您可以执行以下操作：

awk '{getline a; printf("%s\t%s", $0, a);}' file.txt

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对SMA的回答稍加更正

awk“{getline a；printf（“%s\t%s\n”，$0，a）；}”file.txt

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添加换行符一般来说，FASTA文件中的每一个头行后面都可以有多行数据，因此可能需要处理此类情况。如果目标是将所有连续的数据行串在一起，则以下操作可以完成此任务：

awk '/^>/ {if (prev) {print prev;}; prev=$0 "\t"; next}
     {prev=prev $0;} 
     END {print prev}'

另一方面，如果标题仅附加到一行数据，则假定$'…'语法可用，则要使用的sed命令将是：

sed $'/^>/ {N;s/\\n/\t/;}'

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完美的非常感谢。awk命令工作得非常完美。在研究了输出之后，我注意到下一个序列的ID被添加到了前一个条目的序列末尾。知道如何解决这个问题吗？另外，在

sed

方法中，会打印一个“t”而不是选项卡