Python lustre上的批处理作业不工作：awk:cmd。行：1“；意外换行符或字符串结尾“；

我最近开始在Lustre系统上运行Python批处理作业

我最近对shell脚本进行了更改，导致以下错误：

awk: cmd. line:1: NR==
awk: cmd. line:1:     ^ unexpected newline or end of string

脚本如下：

#$ -cwd


# Define parallel environment for N cores
#$ -pe openmp 4



# Validation level (e = reject on all problems)
#$ -w e

# Merge stdout and stderr streams: yes/no
#$ -j yes

#name of job (human-friendly)
#$ -N experiment

# array job parameters below:
# which job IDs in the array to run, eg 1-5 or 3
#$ -t 1
# how many jobs of the array to run at a time
#$ -tc 15


MYFILE=all_experiment_parameters.txt.$RANDOM
python Get_Parameter_Settings.py > $MYFILE
SEED=$(awk "NR==$SGE_TASK_ID" $MYFILE)
echo $SEED

python RunExperiment.py $SEED

这类似于此处“从文件的第i行提取数据”一节中给出的示例中的语法：

---

有人能就错误消息的含义提出建议吗（我不明白为什么当指向代码中间时，它会发出“换行符或字符串结束”的警告），以及如何解决这个问题？我确信这是我错误地做的一个微不足道的更改，因为它在前面工作。

您得到了错误：

awk: cmd. line:1: NR==
awk: cmd. line:1:     ^ unexpected newline or end of string

因为您的环境变量

SGE_TASK_ID

未在脚本的此行中设置：

SEED=$(awk "NR==$SGE_TASK_ID" $MYFILE)

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我已经意识到为什么SGE_任务ID没有设置好。我正在使用

./shell.sh

而不是将其提交到具有

qsub shell.sh

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这完全是初学者的错误

如何设置

$SGE_TASK_ID

？SGE在执行任务的环境中设置一个变量（“SGE_TASK_ID”），该变量可在作业脚本中使用，以标识作业任务（从）要使用的正确输入数据。。。所以我认为它是由Sun Grid Engines自动设置的…？感谢您的回复，但我认为这个变量是自动设置的，正如我在上面的评论中提到的那样？@user3140106错误消息显示它没有设置。我发现另一个堆栈溢出帖子问了类似的问题（）似乎我需要找到为每个作业递增的变量数组ID，并将其设置为$SGE_TASK_ID。您知道如何找到它吗？最好将变量设置在

awk

code:

SEED=$（awk-v var=“$SGE_TASK_ID”'NR==var'$MYFILE）