Python PyFITS:文件已存在
我真的很接近完成一个大型代码,但它的最后一部分似乎失败了,我不知道为什么。我在这里要做的是取一个图像数组,将其与另一个图像数组进行比较,无论初始图像数组是否等于1,我都要在第二个图像数组中屏蔽该部分。然而,我得到了一个奇怪的错误: 代码: 错误:Python PyFITS:文件已存在,python,fits,pyfits,Python,Fits,Pyfits,我真的很接近完成一个大型代码,但它的最后一部分似乎失败了,我不知道为什么。我在这里要做的是取一个图像数组,将其与另一个图像数组进行比较,无论初始图像数组是否等于1,我都要在第二个图像数组中屏蔽该部分。然而,我得到了一个奇怪的错误: 代码: 错误: /home/vidur/se_files/fetch_swarp10.py in objmask(inimgs, inwhts, thresh1, thresh2, tfdel, xceng, yceng, outdir, tmpdir) 12
/home/vidur/se_files/fetch_swarp10.py in objmask(inimgs, inwhts, thresh1, thresh2, tfdel, xceng, yceng, outdir, tmpdir)
122 if newmaskimg[i,j]==1:
123 oimg[i,j]=0
--> 124 pf.writeto('newestmask'+str(inimgs)[5:16]+'.fits',newmaskimg)
125
126
/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pyfits/convenience.pyc in writeto(filename, data, header, output_verify, clobber, checksum)
396 hdu = PrimaryHDU(data, header=header)
397 hdu.writeto(filename, clobber=clobber, output_verify=output_verify,
--> 398 checksum=checksum)
399
400
/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pyfits/hdu/base.pyc in writeto(self, name, output_verify, clobber, checksum)
348 hdulist = HDUList([self])
349 hdulist.writeto(name, output_verify, clobber=clobber,
--> 350 checksum=checksum)
351
352 def _get_raw_data(self, shape, code, offset):
/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pyfits/hdu/hdulist.pyc in writeto(self, fileobj, output_verify, clobber, checksum)
651 os.remove(filename)
652 else:
--> 653 raise IOError("File '%s' already exists." % filename)
654 elif (hasattr(fileobj, 'len') and fileobj.len > 0):
655 if clobber:
IOError: File 'newestmaskPHOTOf105w0.fits' already exists.
如果您不关心覆盖现有文件,
pyfits.writeto
接受clobber
参数以自动覆盖现有文件(它仍将输出警告):
顺便说一句,让我强调一下,您上面发布的代码并不是使用Numpy的正确方法。代码中的循环可以写在一行中,速度会快几个数量级。例如,许多可能性之一就是这样写:
oimg[newmaskimg == 1] = 0
是,添加
clobber=True
。我以前在我的代码中使用过这个,它工作得很好。或者,只需转到sudo rm path/to/file
,然后将它们清除,这样您就可以再次运行它。我也遇到了同样的问题,结果是使用参数clobber
仍然有效,但在AstroPy的未来版本中不受支持
参数
overwrite
执行相同的操作,并且不会发出错误消息。您正在写入一个已经存在的文件(看起来像),如果您将一个os.remove(path)
放在它前面,看看它是否得到解决,该怎么办。(其中path='newestmask'+str(inimgs)[5:16]+'.fits'
)
pyfits.writeto(..., clobber=True)
oimg[newmaskimg == 1] = 0