Python 原木的蛇形问题

我正试图在我的Snake文件中写入一个日志参数，但我不知道我遗漏了什么。这是我的代码：

include:
    'config.py'

rule all:
    input:
        expand(WORK_DIR +"/trimmed/TFB{sample}_R{read_no}.fastq.gz.good",
        sample=SAMPLE_TFB ,read_no=['1', '2'])
rule fastp:
    input:
        R1= SAMPLES_DIR + "/TFB{sample}_R1.fastq.gz",
        R2= SAMPLES_DIR + "/TFB{sample}_R2.fastq.gz"
    output:
        R1out= WORK_DIR + "/trimmed/TFB{sample}_R1.fastq.gz.good",
        R2out= WORK_DIR + "/trimmed/TFB{sample}_R2.fastq.gz.good"
    log:
        log = WORK_DIR + "/logs/fastp/{sample}.html"
    shell:
        "fastp -i {input.R1} -I {input.R2} -o {output.R1out} -O {output.R2out} \
        -h {log.log}"

这是我在执行snakemake后得到的错误

SyntaxError in line 16 of /work/users/leboralli/trofoZikaLincRNAs/scripts/Snakefile:
Colon expected after keyword log. (Snakefile, line 16)

我尝试了很多选择，但都没有成功

此软件fastp有一个用于记录的参数：

-h

，输出为

.html

。没有日志，我的代码可以正常工作

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提前谢谢。

您的蛇形游戏版本是什么？我在v4.8.0上测试了它，您的代码可以正常工作。另外，

config.py

是一个蛇形文件吗？好的，为了模块化，只允许在

include

下使用snakemake文件。请注意，最好使用输入和输出文件的相对路径。这使您的代码更清晰、可读性更强。Snakemake有一个命令行参数来指定工作目录。@JeeYem在我们的服务器上安装的Snakemake是v3.13.3，也许这就是问题所在。我将尝试要求管理员升级版本。谢谢你的提示，@JohannesKöster！我是一个试图编写管道的乞丐，所以任何提示对我都很有价值。